Basic Information

Symbol
CALCRL
RNA class
mRNA
Alias
Calcitonin Receptor Like Receptor CGRPR CRLR Calcitonin Gene-Related Peptide Type 1 Receptor Calcitonin Receptor-Like CGRP Type 1 Receptor Calcitonin Receptor-Like Receptor LMPHM8
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_005795.6
Sequence length
6112.0 nt
GC content
0.3217

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1326.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1450.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1546.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((....)).)))))).))....((((((.((((((...((((((...)))...)))......))))))..)))))).......(((((((...((((((......((..((((..(((.((((.((((.((.((((((((((................))))))...)))).)))))))))))))...)))).))..(((((((((((...((..(((((((...)))))))..))..)))))....))))))))))((((((((....((((.(((((......((((((...............(((((...((((((....((((((((..........(((((((((..((...((((...((.(((((((..((((((......(((((......)))))..........((((((((((.........((((((..(((((........(((((.(((.((((((.(((((..(((((((((..(((((.((((...((((((...((((((...(((......)))..............(((((((((((((.(((.(((.((((((...)))))).(((((((((((.((((...((.......)).))))..)))))).)))))......((((((.(((((.....(((((((.....((((..........))))....)))..)))).((((((..(((((((.(((...))).)))))))..((((((((..(((....)))(((((......))))).......((((((.......((((((......))))))...))))))...)))))))).)))))).(((((...(((..(((((((((((((((...))))))).........(((......)))(((((............))))).((((.(((....))).)).)).)))))))).(((....)))...))).)))))))))).)))))).....((((((.....(((...((((....))))...)))......))))))........))).))).)))))))))))))..(((((((.....(((((((((........))))...(((((.(((.....)))..)))))..(((((((((((((((.((........))))))))))...........))))))).((((.(((......))).))))(((.....)))(.(((((((..((.((((.(((((...(((.((((((((...(((((.(((.(((((((......)))))))((.((....)).))....))))))))...)))))))).)))...)))))((((((....)))).))......)))).)).....)))))))).......)))))......)))))))..............)))))).)))))).)))))))))..)))))))))((((((.(((..(((((......)))))(((((..(((((.((....(((((((((((((((((((.....))))))))).((((((.((((((((....(((((...((((.(..(((((((((.((.(((((.....))))).)).))))).))))))))).))))).(((((.((((.(((((............)))))))))..)))))...((((....))))..)))))))).)))))).......(((((((.....))))))).......(((((((...((((((.(((......((((........(((.((((..(((((((((((((...((((.((((((((.(((((((((.......)))))....))))...)))))............................(((((((..((((....))))..)))))))........(((......)))))).)))).)))))))..))))))....)))))))........))))....)))))).)))...)))))))...(((((..........)))))..)))))))))).....))))))).)))))((((.........))))))).))))))((((((.(((......(((((((.((..((((((...............)))))).)))))).))).....(((((((.........)))))))((((((((....))))))))(((((......))).)).))).))))))))))))))))).))))))))...(((.(((((((.((..........((((((((((.((((((.....)))))).....((.((.((((.((..((.(((((....)))))))..)).)))).)).)).)))))))))).........)).))))))).)))..)))))...))))))......((........))......((((.((.((....)).)).))))....((((((.....))))))(((.((((((..............)))))).)))((((....)))).......(((((((((.((((...))))(((((((((...(((((((((...)))).)))))..(((((......)))))...)))).))))).)))))))))...))))))))))((((((.((((........)))).))))))....((((.((((((((.((((((((.((((((((..(((((..((((((((...............)))))))).)))))......)))))....((((((((.(((.((((((.......)))))).)))))))))))((((.((((((....((((((((...(((((((((..((((..((((((.....))))))........((((.(((((((.((...)).))))))).))))....((((((.((((((((((..((.(((((.(((((.....((((.(((....))).))))......))))).))))))).))))))).))).))))))((((.(.((((.((((.((((((((((.((...(((((..(((((((((((...(((((..............))))).)))))))))))....)))))....((((((.......))))))((((((...((((((...((((((.....))))))...............)))))).)))))).....(((((((.....((((....(((......)))((((((......))))))..........((((((((((((..(((((....(((((((.(((....))).))))))).......................(((((.....))).))(((((((..((((((.........))))))...)))))))........(((((((.......(((.(((.((((((((((.........((((......))))............((((((...))))))......(((..((.(((.(((.............))).))).))..)))..)))))).)))).))).)))........))))))).............)))))..))))))))))))...)))).....))))))))).)))))))))).))).).)))).).))))......(((((..........))))).((((......)))).((((...((((((((((..(((((.(((..((.((((.(((((...(((..(((.(((((((...(((((....)))))........(((((..((....))..)))))))))))).)))..))))))))))))..((((((....))))))(((((...(((((..((..((.......))...))((((.(((..........))).)))).....................((((((......))))))))))).....)))))..................))..))).)))))))))))))))..))))...(((((......((((((((............))))))))))))).((((........))))...))))..))))))))).))))))))....)).)))).)))).(((..(((((((....)))))))..)))....))).)))))))))))))))).)))))))))).))))))))))))).))..))))))))).(((((((.(((((((.(((((.......((((......(((((((...)))))))((((((((((......(((.....))).........((((((..............)))))).)))))))))).(((((((..((((((....))))))...)))))))......)))).......)))))...(((((((((....)))))))))..))))))).))))))).((.(((((((((((((((.........((((((((((((((((((...((((((((....((((((((..((...((((((((((....)))).))))))))..))))))))....((((((((((((((((((((((((......)))(((.....)))............(((((.(((....))).)))))..((((.(((((........))))).)))))))))))))..))))))....))))))...(((......)))...(((((((.....)))))))..(((((.....)))))....(((((((..((.((..((((...(((((((((..((.((((((.(((((..........)))))..)))))).)))))))))))...))))..)).)).)))))))(((((....)))))))))))))..........................(((((((((((((..((((.............))))..)...((((.(((((.((.....)).))))).))))..............(((((............)))))........((((((.......)))))).....(((((..((..((((......))))..))....)))))((((((..((((.(((((..((((.((((.((.....)).)))).))))..)))))))))..)))))).....))))))))))))(((((..((.......))..))))).((((((((............))))))))...(((((....))))))))))...))))))))..)))))........)))))))).))))))).)).....(((((.((((((....((((((.(((((..((.((((.(((..........((((....))))(((((.....))))).............))).)))).))..)))))..)))))).)))))).).))))....))))))))(((((((((((...............))))))))))).(((((((.(........).))))))).(((((...(((((......))))))))))........)))))).......))))).(((((((.....)))))))((.((((((.(((.((......)).))))).)))).))((((((((......))))))))..))))))..............((((((((((((((.((.((..((((...(((.(.........).))).....))))..)))).)))))))))))))).....((((((((...........................)))))))).....((((((.....((..(....)..)).....)))))).....))))))))).....((((((.((.((((((..((((..........(((((....)))))..............(((...(((((((....))))))))))..))))...)))))).)))))))).((((((((......(((((..(((((((((....)))))....)))).....)))))......)))))))).....))))))))...((((((((........))))))))))...)))))))...........((((((((....))))).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{,,{,,,((((((((....|}.))))))||}....((((((.((((((...{{((((...)))...))}......))))))..)))))).......(({{{{{...|||||||.(((((,..,,,,}}|||.{{{{.((((.((.((((((((((...,............))))))...)))).))))))}}}}}}}...)})),)),.{((((((((((...((..(((((((...)))))))..))..)))))....))))))}}}}{((((((({..((((..{(((((((...(((.{.{((((.{{...((({((.,,{((((((,,...,,{,,,,,,.....{(({.(((((((((,.((...((({..,((.(((((((..((((((.,.,..(((({......})))}},........{(((((((((,{.,.....,,,{({,,({{{{,,......(((((.(((.((((((.{(({,..(((((((((..(((({{((((...((((((..,((((,,{{((({,,((,,({{{{(((({.(((((({,((....)))))))))}})))|||{|{.,,)))))}.{(((({(((((.((({...{{.......}}.})}}..)))))}.))))).........}}}..}}))),},..,,|.,.((((((.((((((.((((((((((.((.((..((((((((((({..((((((.(((...))).))))))|{,((({.{{...(({|,..,},(((((......)))))...,||,,,,,||||.....((((((......))))))..((({(((,{,{((,{{{((((({{{((((,,(((((,,,{((({,,.{{{{{{{...})))},},,.....,...(((((((((({.,({((((.{{(({{{(({{,.,{{(.{{{....})),|||||.,},,,,,.}|||,}..}}},,.}}}}}.{(((((..(((((((.....)))))...))..)))))|(((....))}}..{,,......}|}.........,|{,{{{(.((......)).)))}.},.........{(({||,((((........))))...||||{.{{,....,))),.})))),,{|||||||||||{{||||,,,....,)))))))))),...,,},,,,|||||{{(({{{.{|{|,,,,,|{|{(|{{{{.....)))))))),,))})}}})))})}|}|}|.}}|||.||||||,|}}}||||}}|{{,{((((((......)))))))||}||,...,},}}||,,|}|}}}}}...,},}}}))})),...))))))))),,)}))}}}.,}}.,,,},,,,,...,)))))))..))))..)).)).)))......))))))),)))))}.)))))).})),,.)))))).)))))))))..))))))))){(((((.((({.{((((......})))}(((((..(((((.((..,,{(((((((((,{(((((((.....)))))))||.((((((.((((((((.,..(((((...((({,(..(((((((((.((.(((((.....))))).)).))))).))))))))).))))).,{(((,((((.(((((............)))))))))}.,})}}...{(((....)))}..)))))))).)))))).,,....(((((((.....)))))))....{{,(((((((...{{({{{.|,,{{,{,.({({........(((.((((,.(((((((((((((...((((.(({(((((,,,{{(((((.......)))))....||},...}}}}},,,.......},,...|{,.......,.,{{|||{..||||},,,}},},,}}})}},}}}.,,,,(((......)))))).)))).))))))}.,)))))).,..)))}}}}........|}}}....}}}},)})))...))))))),}}|((((..........}))))..)))))))))),....))))))).)))))|({{.........))))))).)))))}((((((.(((......(((((((.((..((((((.{.{.......,.}.)))))).)))))).))).....(((((((.........)))))))((((((((....)))))))){{(((......))).}}.,,,.))))))))))))))))).))))))))...(((.{((((((.{{..........((((((((((.((((((.....)))))).....((.((.((((.((..((.(((((....)))))))..)).)))).)).)).)))))))))).........},.))))))}.)))..||,(({{..{{{|.......,,...}}}}.))}}....((((.{(.({....}).)).))))...,{{((((.....))))||(((.((((((..,{,.....},,.)))))).)))||((,...,,,)},.....{(((((({{,((((...|}},,|||||||{...(((((((((...))))}}))))..{{{{{...,,,|||||...}}))}}))}},))))))))}...)))))))))}((((((.((((........)))).))))))....,(((.((((((((.((((((((.((((((((.,(((((..((((((((...,,..........)))))))).))))}.....,)))))...,{{(({(((,(({.{{({{{.....,,))))}).}))))}}}}}{((((.{(((((....((((((((...(((((((((..((((..((((((.....))))))....(((((((((((((((,{((,,,{..{||||||||....,,,{(((((,{((({(((({.{(,.{((({,,,,,,|{{{{((,(((({.,((((,{{|||{||....,,,,...}},,.,)))))))..)),))))))..|||||||,,,,,.....}),,)))).}}}..}}}},{{(((((....}}}}}}}...,,,,},,,,..,,.,,.,..,,.))))))))))))))).....(((((((.......))))))),{((((((.{,,.....{((((({{{{,|}|||,..{{{{((,,,,..,|||......,,(({..,.,|||{{{.....,,,{,,,,.,,.....,}}|||{{{.,((,,..,||,,..........((((((((((((..(((((....(((((((.(((....))).))))))).................,,....{{,,,.,...},}.,,(((((((..((((((.,.....,.))))))...))))))).......,((((((({{{...,((,.(({,(({((((({..........|,,,.,,,,}||}}..,,,..}}}}.((((((...})))))...,,.(((..((.(((.{((..,,....,,...))}.))).))..))).}))))))})))}.}}},||}...,,...}}|}},..,....,,,,}}.)))))..)))))))))))).,.,}))}.,,,))))}})))}}}))},},...))))))}}},,,}}.)}}}})))}}.(((((({.{{{.......})).)))))))....((((,,,((((((((((,.{((((.(((.,{{.(({{.{{{{(...(((..(((.{{(((({...(((((....)))))........((({(..((,...|}..}}}}}}}}}}}}.}}}..)}}}}}}}}}}}..||{(((,,,,||||,,..,.})))),|))},|{{,{,....,,,||,..}}{({{.{{{..,,,..,,,}}}.))}}....................,((((((......})))))}..,,.........,,,..............,,))}}))).)))))))))))))))..}}}}.,,((,{,......((((((((............)))))))))))))})}}}}}.....}))))}},))))..))))))))).))))))))....))},))}.))))}{((..(((((((....)))))))..))}....))).)))))))))))))))).))))}))))).))))))))))))).)),.))))))))).}|||{{{.{{{{{{{.(((((.......((((.,,...(((((({...,)))))}((((((((((......(((.....))).........((((((..........,...)))))).)))))))))).{(((((,..((((({....})))))...)))))),...,,.)))).......)))))...(((((((((....))))))))).,|||||||{,|||||{((({(((((((((((((((.........((((((((((((((((((...((((((({....((((((((..((..,((((((((({....)))).))))))))..))))))))....,(((({((((((((((((((((((.,,,,.}}}{{,.,,,,,)),...........{((((.(((....))).))))}..((((.(((((........))))).)))))))))))))..)))))}...,)))}}}..,{{{...,,,,.....(((((((.....)))))))..(((((.....)))))....{(((((({,,(,{...((((...(((((((((,.,(.((((((.(((((.,,.....,,)))))..)))))).)))))))))))...)))),,,),)).}}))))}(((((....)))))}})))))).........................{(((((((((((({,,((((,{,....,.....|||,......,{{{.{{{((.((,..,.}}.}}}}}.}}}},,,,..........(((((............)))))......,.,|||||.}}}}},)}))}}.....(((({,,({..{(({......)))).,))....)})}}((((((..((((,({(((,.((((.((((.({.....)).)))).)))),,),)))))))..))))))....,))))))))))))|{(((..((.......)}..}))},.((((((((.{.{,....}.}))))))))...(((({....)))))))))}..,))))))))..)))))........)))))))).)))))))..,.....,,{{{{(({{,,....{(((((,(({{{..,,.{{{,{((((,,....,.,{(((....))))(((((.....)))))....,.,|{,..{{{{{.,,..||{{|||||,{||||,|,{{,||.....{{{(((({.|.....},)))}}}}}.......,{{{{,....})))}|{{{{,(((((((.(........}.))))))}.,,,,,.,.|})}|}}}.,})),)))))))}}})))..,.))))}...,,|)||,,,{|||{{({{,{{||||||}{{.((((((.(((.((......)}.))))),}))).}}((((((((......)))))))),{{||,,,||{|||..,{,,..((((((((((((((.{(.{{,.,{{{,{,(((.,.........,.}))....})))),,,})}.))))))))))))))......,((((({...,...............{({{....,....)))}...,|(({((.....({,.,.......}}.....)))))).....,,,},)}}},,.....,,,,,)))}.,},,...}}}},........|||||,}}}))))}......,},,,}.)))}}}}|||,,{..}}}})))))))))))).}...})))))...}}.))))).,))}...)))))))}...}}}}.}||}))}}}||}|}},,.,,||||||||,...........)))|}}}}}}..}}}},,,....((((((((........)))))))),},.,)))))}}....,,,....||{{((({....})))).}})......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGAACAACCUCUCUCUCUCCAGCAGAGAGUGUCACCUCCUGCUUUAGGA… 5947 nt 0.3215
AGAACAACCUCUCUCUCUCCAGCAGAGAGUGUCACCUCCUGCUUUAGGA… 6180 nt 0.3233
AGAACAACCUCUCUCUCUCCAGCAGAGAGUGUCACCUCCUGCUUUAGGA… 6074 nt 0.3243
AGAACAACCUCUCUCUCUCCAGCAGAGAGUGUCACCUCCUGCUUUAGGA… 6112 nt 0.3217
Summary

Enables adrenomedullin binding activity; adrenomedullin receptor activity; and calcitonin gene-related peptide receptor activity. Involved in several processes, including G protein-coupled receptor signaling pathway; cellular response to sucrose stimulus; and receptor internalization. Located in several cellular components, including endoplasmic reticulum; endosome; and lysosome. Part of CGRP receptor complex and adrenomedullin receptor complex. Implicated in hereditary lymphedema. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.