Basic Information

Symbol
CALM3
RNA class
mRNA
Alias
Calmodulin 3 PHKD3 PHKD Phosphorylase Kinase Subunit Delta 3 Phosphorylase Kinase Subunit Delta Prepro-Calmodulin 3 Calmodulin-3 Calmodulin 3 (Phosphorylase Kinase, Delta) Epididymis Secretory Protein Li 72 Calmodulin-1 Calmodulin-2 HEL-S-72 CaMIII CALML2 CAMIII CPVT6 LQT16 CALM CAM1 CAM2 CAMB CAM3 CAMC CaM
Location (GRCh38)
19:46601074-46610787
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005184.4
Sequence length
2184.0 nt
GC content
0.5614

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-802.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -843.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 613.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001329921.1 NCBI
GCGGCGAGGGAAAGUAGUCCGGCGACGGGAGCGAGCGCGCGCGCGCCCG… 2179 nt 0.5608
NM_001329922.1 NCBI
ACUGCAGAGGAGGAGGAGGGUGAGGUGCAAGCUUAUGGGAGGAAGAGCC… 2227 nt 0.5514
NM_001329923.1 NCBI
AGCACUGCAGAGGAGGAGGAGGGAAGAACGCGGCUGGGUGGAAGACACC… 2153 nt 0.5532
NM_001329924.2 NCBI
AGUGAGUGUGGAGGCGCGGACGCGCGGCGGAGCUGGAACUGCUGCAGCU… 2182 nt 0.5614
NM_001329925.2 NCBI
AGUGAGUGUGGAGGCGCGGACGCGCGGCGGAGCUGGAACUGCUGCAGCU… 2153 nt 0.5611
NM_001329926.2 NCBI
AGUGAGUGUGGAGGCGCGGACGCGCGGCGGAGCUGGAACUGCUGCAGCU… 2176 nt 0.5620
NM_005184.4 NCBI
AGUGAGUGUGGAGGCGCGGACGCGCGGCGGAGCUGGAACUGCUGCAGCU… 2184 nt 0.5614
Summary

This gene encodes a member of a family of proteins that binds calcium and functions as a enzymatic co-factor. Activity of this protein is important in the regulation of the cell cycle and cytokinesis. Multiple alternatively spliced transcript variants have been observed at this gene. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CALM3 was notably upregulated in excitatory neurons in post-mortem brain tissue samples with intervals of 24 to 54 hours [Guo et al. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147708].