Basic Information

Symbol
ACSL1
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Synthetase Long Chain Family Member 1 LACS2 LACS1 FACL1 LACS ACS1 FACL2 Fatty-Acid-Coenzyme A Ligase, Long-Chain 2 Long-Chain Fatty-Acid-Coenzyme A Ligase 1 Long-Chain-Fatty-Acid--CoA Ligase 1 Long-Chain Fatty Acid-CoA Ligase 2 Long-Chain Acyl-CoA Synthetase 1 Long-Chain Acyl-CoA Synthetase 2 Lignoceroyl-CoA Synthase Arachidonate--CoA Ligase Palmitoyl-CoA Ligase 1 Palmitoyl-CoA Ligase 2 Acyl-CoA Synthetase 1 Phytanate--CoA Ligase EC 6.2.1.3 LACS 1 LACS 2 Fatty-Acid-Coenzyme A Ligase, Long-Chain 1 Paltimoyl-CoA Ligase 1 EC 6.2.1.15 EC 6.2.1.24 EC 6.2.1
Location (GRCh38)
4:184755501-184826853
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Sudden cardiac death diagnosis Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001995.5
Sequence length
3712.0 nt
GC content
0.4518

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1122.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1193.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 922.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286708.2 NCBI
GUUAAGAACCAAGGGCAUAUAAAGACAGAUGGGAGGAGACCCUGGCCGG… 3751 nt 0.4484
NM_001286710.2 NCBI
AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGAAUUCAGCUUAGAGAACUAUCA… 3686 nt 0.4474
NM_001286711.2 NCBI
AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… 3610 nt 0.4507
NM_001381877.1 NCBI
AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… 3777 nt 0.4538
NM_001381878.1 NCBI
AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… 3783 nt 0.4544
NM_001381879.1 NCBI
AGAUUCCUGGAGCACCAGGGCCCUACCUGCCGUGGUUAUCAGAUCUGUC… 3851 nt 0.4498
NM_001381880.1 NCBI
AGAUUCCUGGAGCACCAGGGCCCUACCUGCCGUGGUUAUCAGAUCUGUC… 3786 nt 0.4477
NM_001381881.1 NCBI
AGCAUCUUGCCAGCUUGGGUUGCUGCGUUAAGGAAAGAUGUCAGGCUUU… 3899 nt 0.4458
NM_001381882.1 NCBI
AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGAAUUCAGCUUAGAGAACUAUCA… 3686 nt 0.4479
NM_001381883.1 NCBI
AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGGUGAGUGGUUUUGUUAAGUGCU… 3773 nt 0.4477
Showing 1 to 10 of 18 entries
Summary

The protein encoded by this gene is an isozyme of the long-chain fatty-acid-coenzyme A ligase family. Although differing in substrate specificity, subcellular localization, and tissue distribution, all isozymes of this family convert free long-chain fatty acids into fatty acyl-CoA esters, and thereby play a key role in lipid biosynthesis and fatty acid degradation. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]

Forensic Context

A study in humans identified the ACSL1 as a core ferroptosis-related diagnostic biomarker for heat stroke, with single-cell RNA sequencing showing its high expression in neutrophils, dendritic cells, and monocytes, and receiver operating characteristic analysis in a validation cohort demonstrating an area under the curve of 1.0 [Yin et al. DOI:10.1186/s12920-025-02188-3]. Another study in humans identified the ACSL1 as a mitochondria-related hub gene significantly upregulated in acute myocardial infarction, with real-time quantitative polymerase chain reaction validation confirming its diagnostic potential, showing an area under the curve of 0.878 [Xu et al. DOI:10.1097/MD.0000000000045611]. A study in mice demonstrated that the ACSL1 transcript is part of a seven-gene set in brain tissue used for postmortem interval (PMI) prediction via linear regression, where this specific set achieved an R² of 0.95 and a slope of 0.87 between predicted and actual PMI [Hunter et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2017.02.027].