Basic Information

Symbol
CALY
RNA class
mRNA
Alias
Calcyon Neuron Specific Vesicular Protein DRD1IP NSG3 Neuron-Specific Vesicular Protein Calcyon Dopamine Receptor D1 Interacting Protein CALCYON Calcyon D1 Dopamine Receptor-Interacting Protein (CALCYON) Calcyon Neuron-Specific Vesicular Protein D1 Dopamine Receptor-Interacting Protein Calcyon Protein
Location (GRCh38)
10:133324072-133336980
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015722.4
Sequence length
2260.0 nt
GC content
0.6748

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1019.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1058.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 485.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321617.2 NCBI
AUCCACAUCCGCAUCGUCGUCCUCCCCGACCGCGUCCUGCAGCAGCUGC… 2420 nt 0.6748
NM_015722.4 NCBI
AUCCACAUCCGCAUCGUCGUCCUCCCCGACCGCGUCCUGCAGCAGCUGC… 2260 nt 0.6748
Summary

The protein encoded by this gene is a type II single transmembrane protein. It is required for maximal stimulated calcium release after stimulation of purinergic or muscarinic but not beta-adrenergic receptors. The encoded protein interacts with D1 dopamine receptor and may interact with other DA receptor subtypes and/or GPCRs. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the CALY as a significant differentially expressed gene in the dorsolateral prefrontal cortex in individuals with alcohol use disorder, where it encodes the calcyon protein which interacts with the D1 dopamine receptor and is upregulated in AUD, a pattern similarly reported in the PFC of individuals with schizophrenia [Willis et al. DOI:10.1038/S41380-024-02777-1].