Basic Information

Symbol
CAMK1
RNA class
mRNA
Alias
Calcium/Calmodulin Dependent Protein Kinase I CaMKI-Alpha CaMKI Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Type 1 CaM Kinase I Alpha EC 2.7.11.17 CaM-KI CaM Kinase I EC 2.7.11
Location (GRCh38)
3:9757346-9770606
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003656.5
Sequence length
1453.0 nt
GC content
0.5829

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-597.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -619.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 206.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003656.5 NCBI
AGCUCCAGCAAGAGCGCGGGCGGGUGGCCCAGGCACGCAGCGGUGAGGA… 1453 nt 0.5829
Summary

Calcium/calmodulin-dependent protein kinase I is expressed in many tissues and is a component of a calmodulin-dependent protein kinase cascade. Calcium/calmodulin directly activates calcium/calmodulin-dependent protein kinase I by binding to the enzyme and indirectly promotes the phosphorylation and synergistic activation of the enzyme by calcium/calmodulin-dependent protein kinase I kinase. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly downregulated the CAMK1 in microglia, which is associated with the calcium signaling pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].