Basic Information

Symbol
CAMKK2
RNA class
mRNA
Alias
Calcium/Calmodulin Dependent Protein Kinase Kinase 2 CAMKKB KIAA0787 CAMKK Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Kinase 2, Beta Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Kinase Beta Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Kinase 2 CaM-Kinase Kinase Beta CaM-Kinase Kinase 2 CaM-KK Beta MGC15254 CaM-KK 2 Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Beta CAMKK Beta Protein EC 2.7.11.17 CaMKK Beta EC 2.7.11 CaMKK 2
Location (GRCh38)
12:121237675-121298308
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001270485.2
Sequence length
4905.0 nt
GC content
0.5366

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1850.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1938.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1291.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270485.2 NCBI
AGAGCAAGCUGAGCCGAGCCGAGCCGAGCUGGGGGCGCAGAGCGCGGGA… 4905 nt 0.5366
NM_001270486.1 NCBI
GUGGCUCCGCUGCCGGAUGGGAGUGCCCCAGUGUGCUGGAUGAAGCUGG… 4523 nt 0.5238
NM_006549.4 NCBI
GAGUGUCCCUACGGCCUAGAAAUACAAGAGAAGCACAUCGGAACGGGCU… 5114 nt 0.5330
NM_153499.3 NCBI
GAGUGUCCCUACGGCCUAGAAAUACAAGAGAAGCACAUCGGAACGGGCU… 5071 nt 0.5334
NM_153500.2 NCBI
GAGUGUCCCUACGGCCUAGAAAUACAAGAGAAGCACAUCGGAACGGGCU… 4942 nt 0.5316
NM_172214.3 NCBI
GAGUGUCCCUACGGCCUAGAAAUACAAGAGAAGCACAUCGGAACGGGCU… 2478 nt 0.5670
NM_172215.3 NCBI
GAGUGUCCCUACGGCCUAGAAAUACAAGAGAAGCACAUCGGAACGGGCU… 2349 nt 0.5649
NM_172216.2 NCBI
GAGUGUCCCUACGGCCUAGAAAUACAAGAGAAGCACAUCGGAACGGGCU… 4985 nt 0.5312
NM_172226.3 NCBI
AGAGCAAGCUGAGCCGAGCCGAGCCGAGCUGGGGGCGCAGAGCGCGGGA… 4862 nt 0.5370
Summary

The product of this gene belongs to the Serine/Threonine protein kinase family, and to the Ca(2+)/calmodulin-dependent protein kinase subfamily. The major isoform of this gene plays a role in the calcium/calmodulin-dependent (CaM) kinase cascade by phosphorylating the downstream kinases CaMK1 and CaMK4. Protein products of this gene also phosphorylate AMP-activated protein kinase (AMPK). This gene has its strongest expression in the brain and influences signalling cascades involved with learning and memory, neuronal differentiation and migration, neurite outgrowth, and synapse formation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. The identified isoforms differ in their ability to undergo autophosphorylation and to phosphorylate downstream kinases. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

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