Basic Information

Symbol
CAMLG
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Modulating Ligand CAML GET2 Guided Entry Of Tail-Anchored Proteins Factor CAMLG Calcium Signal-Modulating Cyclophilin Ligand Calcium-Modulating Cyclophilin Ligand Cyclophilin B-Binding Protein Calcium-Signal Modulating Cyclophilin Ligand CDG2Z
Location (GRCh38)
5:134737608-134752705
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001745.4
Sequence length
2171.0 nt
GC content
0.4275

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-616.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -660.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 584.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001745.4 NCBI
CUCUAGUCAUCGCCCUCGCAGCGGCGGCCAACAUCACCGCCACUGCCAC… 2171 nt 0.4275
Summary

The immunosuppressant drug cyclosporin A blocks a calcium-dependent signal from the T-cell receptor (TCR) that normally leads to T-cell activation. When bound to cyclophilin B, cyclosporin A binds and inactivates the key signaling intermediate calcineurin. The protein encoded by this gene functions similarly to cyclosporin A, binding to cyclophilin B and acting downstream of the TCR and upstream of calcineurin by causing an influx of calcium. This integral membrane protein appears to be a new participant in the calcium signal transduction pathway, implicating cyclophilin B in calcium signaling, even in the absence of cyclosporin. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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