Basic Information

Symbol
CAPG
RNA class
mRNA
Alias
Capping Actin Protein, Gelsolin Like MCP AFCP Capping Protein (Actin Filament), Gelsolin-Like Macrophage-Capping Protein Epididymis Secretory Protein Li 66 Actin-Regulatory Protein CAP-G Actin Regulatory Protein CAP-G Gelsolin-Like Capping Protein Macrophage Capping Protein HEL-S-66
Location (GRCh38)
2:85393587-85422017
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001747.4
Sequence length
1250.0 nt
GC content
0.5888

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-515.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -535.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((..(((.((...(((((.((.((..(((((((....)))))))((((((((((((.((...(((((((.......))))))))).))).))))))))).((((....)))).((.((((((..(((((.((.(((.(((((((....))))))).))).(((((((.((.....((.(((((((((((((.(((.(((((.((((.((((.(((.....)))))))))))....))))))))((((((((.(((.(((((((((.........((((((.....)))))).)))))))).).))).))))))))...........)))))))))(((..((.((((((..(((((.((..((....(((.(((..((((((((....))))))))..))))))))..)))))))....(((....(((...)))....)))....)))))).))..)))..(((((........))))).....)))).))....)).)))))))...(((((..(((((((((.(((((((....(((((((((..(((.(((.....((((......)))).))).))))))))))))..))))))).))...)))))))....)))))(((((((..((((..((((....(((((((((.(((((((((.((((..((.....))))))))))...)))))....((((((.....))))))....(((((....)))))))).))))))......))))..))))...)))))))....)))))))..)))))).)).((((((.((((.....))))(((((....)))))))))))....)).)))))))...)).)))..))))))))))..))......(((((((.((((.(((((.(((((((..((((((....(((..(((((.(((((....(((.(((.....))).)))....))))).)))))....)))....))))))......))))))).))))).)))).)))))))........((((((((((......((((((.....)))))))))))))))))))))))))...))).))....))))))).........)))))...)))))))(((((....))))).(((((.((....)))))))............((((((..((.(((.....))).))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((((((((,,((.(((((((((..{(((((((((((..(((.((...(((((.((.{,.,(((((((....)))))))|(((((((((((.((...(((((((.......))))))))).))).))))))))}.((((....)))).{,.((((((..((((,,((.(((.(((((({.,,,|||||}|{|||.(((((((.{(.,...{(,((({(((((((((.{{{.{(((({((((.((((,(((,....}||}||}}}}),},,}}})}}))|||||{|{||||,|((({((({{{,{..,,.((((((,,,..)))))),)))))}}).}.)))}))))))})}}...}.},..})))))))}{{(..({.((((((..(((({{((..((....(({{(((..((((((((....))))))))..))))))))..)))))))...,,((,{{.{({...|||.,..)))|..|)))))).}}..)}}|,(((((.,.....,))))).|...}}}}.}},,,,}}.)))))))..,|(({{{,(((((((((.(((((((....(((((((((,,((({.,({,...{|||...,,,,},,.))),.),)))))))))..))))))).))...)))))))..,)))))},{{((((..((({,.((||,,,.{{{{{{{||.|((({{{{,.|||{..|{.....)))))))))),},))))}.},,||||||,.,,,)))}),.}}}|||||,,,,))))}}||,||}}}}{{{...,)))..}))}.,,)))}))}....)))))))..)))))).||.((((((.((((.....))))(((((....))))))))))).},.}).)))))))...)).)))..))))))))))..}}....,.(((((((.((((.(((((.(((((((..((((((....(((..(((((.(((((....(((.(((.....))).)))....))))).))))),,}.}}}..,.))))))......})))))).))))).)))).)))))))..,.....((((((((((......((((((.....)))))))))))))))))))))))))...},,.},,,,)))))))).........)))))...)))))))(((((....))))).(((((.((....)))))))............((((({.,((.(((.....))).))))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256139.2 NCBI
AGCGCCCAGGGCCUCGGAGCAAGGCGUUGGCAGAUCUGAAGACAGCAUG… 1233 nt 0.5912
NM_001256140.2 NCBI
GAGAAGCCGGGUGGGGCAGGCUGGAAGGAAGACGAACCUACGAAGCAGA… 1205 nt 0.5900
NM_001320732.2 NCBI
GCAAACUCUGGAAGACCUUGGCUGAGGGUCUAGGUGGACUGUCUGAGAU… 1247 nt 0.5862
NM_001320733.2 NCBI
GAAGAAAGGAAAGUAGGAGUGUUGAAAGAUCUGAAGACAGCAUGUACAC… 1228 nt 0.5831
NM_001320734.2 NCBI
GAGAAGCCGGGUGGGGCAGGCUGGAAGGAAGACGAACCUACGAAGCAGA… 1157 nt 0.5877
NM_001747.4 NCBI
GAGAAGCCGGGUGGGGCAGGCUGGAAGGAAGACGAACCUACGAAGCAGA… 1250 nt 0.5888
Summary

This gene encodes a member of the gelsolin/villin family of actin-regulatory proteins. The encoded protein reversibly blocks the barbed ends of F-actin filaments in a Ca2+ and phosphoinositide-regulated manner, but does not sever preformed actin filaments. By capping the barbed ends of actin filaments, the encoded protein contributes to the control of actin-based motility in non-muscle cells. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that monocyte chemotactic protein 2 (MCP-2) gene expression was upregulated at 3 days following a second-degree scald burn injury, as part of a broader chemotaxis-related response [Feezor et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00101.2003]. A study in mice demonstrated that in a closed head weight-drop model of mild traumatic brain injury, the transcript for the CAPG (Capg) was upregulated 3.8-fold in the injured ipsilateral neocortex three days post-injury, as identified via GeneChip microarray analysis and associated with cell projection biogenesis [Israelsson et al. DOI:10.1089/neu.2008.0676].