Basic Information

Symbol
CAPNS2
RNA class
mRNA
Alias
Calpain Small Subunit 2 Calcium-Dependent Protease Small Subunit 2 MGC12536 MGC14804 CSS2
Location (GRCh38)
16:55566684-55567687
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032330.3
Sequence length
1004.0 nt
GC content
0.4582

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-310.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -327.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 237.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((..(((.(((((((((..(((((((((.....(((....)))..(((((..........)))))((((((((.(((........))).))))))))....((((((((.((((...)))).))))))))......)))))))))..))))))))).)))))))...(((((((.(((((.....((((((..((((................(((((...)))))))))...)))))).....)))))......(((((((.....((((((((.(((((((.....)))))..(((.(.((....)).))))........((((((((.(((((((.((.((.(((((...)))))..))........(((((...((((((((......(((.........((((((((((.....))))))))))....((((((....(((((((((((...))))..))))))))))))).))))))))))).)))))....(((((.(((((.((..((((.....(((.(((.(((((((..(((((.(((((((((((......))))))))........)))))))).((((((.((((.....))))))))))......))))))))))...)))..))))))))))).)))))(((.((((((.((..((........))..)).)))))).))))).))))))))))(((((((..((..(((.(((.((..((((((....))))))...)).))).)))..)).))))))).........)))))(((((..((((...........)))).)))))...((((..(.(((((....))))))..))))((((..(((((((((((((.(((((...........)))))..)))))).........)))))))...))))....))))))).....))).....))))))).........(((........))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......((((.,(((.(((((((((..(((((((((..,,.(((....)))..(((((..........)))))((((((((.(((........))).))))))))....((((((((.((((...)))).))))))))......)))))))))..))))))))).)))))))...((((((({(((((.....((((((..,,,.,,,......,}|.({{{{(((...))))))).}...)))))).....)))))...{{{(((({,{,{((,,((((((,,{{(((((.....)))))..(((((((.((((({{{{,,......,,|,,||(({,{{(((({.{{|{{,(((((,..||||},,|||.,{{,,.{((((...((((((((..,,,.,,,....,},..((((((((((.....))))))))))....((((((....(((((((((((...)))),.})))))))))))).},,)))))))).))))),,..|{|||.((({,|{{,,{({{.....(((.(((.(((((({.{(({,,.,,.((((((((......)))))))){({{{{{.|{||||((,(({{((.{{||.....)))))))))).)),..}))))))))),..)))..))})))))))).}|}}}(((.((((((.((.,((........))..)).)))))).)))||,,}))))))))||,,,||,,||,.,,|}}}|..,..((((((....)))))).))))).))))))}||{,.{{{{{,,....,,})))|,})),}})},||.||.{{{{,....,))})}}}},..{(((..{.(((((....))))))..)))|((((..(((((((((((((.(((((...........)))))..)))))).........)))))))...)))),....))}.)))}}}.})),,,,.})))))),.....}}}}|}}.......,,))))))))........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032330.3 NCBI
ACUUGAACUCCAUUUCAUCUUUUUUCAUACCAUCUCUAAGAUUGCUGCC… 1004 nt 0.4582
Summary

Enables calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity. Predicted to be located in cytosol and plasma membrane. Predicted to be part of calpain complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.