Basic Information

Symbol
CAPRIN1
RNA class
mRNA
Alias
Cell Cycle Associated Protein 1 Caprin-1 RNG105 GPI-Anchored Membrane Protein 1 GPIAP1 M11S1 Cytoplasmic Activation- And Proliferation-Associated Protein 1 Cytoplasmic Activation/Proliferation-Associated Protein-1 Membrane Component Chromosome 11 Surface Marker 1 GPI-Anchored Protein P137 RNA Granule Protein 105 GPI-P137 GPIP137 P137GPI Membrane Component, Chromosome 11, Surface Marker 1 Activation/Proliferation-Associated Protein 1 Cell Cycle-Associated Protein 1 Caprin 1 CONDCAC GRIP137 NEDLAAD
Location (GRCh38)
11:34051674-34102610
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005898.5
Sequence length
5514.0 nt
GC content
0.4153

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1524.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1631.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1631.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005898.5 NCBI
CACUAGGAGCGGCUCUCGGUGCAGCGGGACAGGGCGAAGCGGCCUGCGC… 5514 nt 0.4153
NM_203364.3 NCBI
CACUAGGAGCGGCUCUCGGUGCAGCGGGACAGGGCGAAGCGGCCUGCGC… 3505 nt 0.4368
Summary

Enables several functions, including ATP binding activity; molecular condensate scaffold activity; and signaling adaptor activity. Involved in membraneless organelle assembly; positive regulation of stress granule assembly; and regulation of gene expression. Located in cell leading edge and cytosol. Is active in intracellular membraneless organelle. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the CAPRIN1 as one of 11 mRNA markers with statistically significant rhythmic expression in blood, qualifying it as a candidate for estimating blood deposition time [Lech et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2015.12.008].