Basic Information

Symbol
CARD11
RNA class
mRNA
Alias
Caspase Recruitment Domain Family Member 11 CARMA1 BIMP3 Caspase Recruitment Domain-Containing Protein 11 Bcl10-Interacting Maguk Protein 3 CARD-Containing MAGUK Protein 1 Carma 1 Caspase Recruitment Domain Family, Member 11 Card-Maguk Protein 1 IMD11A BENTA IMD11 PPBL
Location (GRCh38)
7:2906141-3044228
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032415.7
Sequence length
4287.0 nt
GC content
0.6035

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1721.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1790.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 872.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001324281.3 NCBI
CUCCUGCCUCCUCUGGCCUUCGGACUCCUGCCCGCGCCGCCCGCAGCCC… 4348 nt 0.6033
NM_032415.7 NCBI
CUCCUGCCUCCUCUGGCCUUCGGACUCCUGCCCGCGCCGCCCGCAGCCC… 4287 nt 0.6035
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the membrane-associated guanylate kinase (MAGUK) family, a class of proteins that functions as molecular scaffolds for the assembly of multiprotein complexes at specialized regions of the plasma membrane. This protein is also a member of the CARD protein family, which is defined by carrying a characteristic caspase-associated recruitment domain (CARD). This protein has a domain structure similar to that of CARD14 protein. The CARD domains of both proteins have been shown to specifically interact with BCL10, a protein known to function as a positive regulator of cell apoptosis and NF-kappaB activation. When expressed in cells, this protein activated NF-kappaB and induced the phosphorylation of BCL10. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for CARD11 Gene

Forensic Context

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