Basic Information

Symbol
CARM1
RNA class
mRNA
Alias
Coactivator Associated Arginine Methyltransferase 1 PRMT4 Histone-Arginine Methyltransferase CARM1 Protein Arginine N-Methyltransferase 4 Coactivator-Associated Arginine Methyltransferase 1 EC 2.1.1.319 EC 2.1.1
Location (GRCh38)
19:10871553-10923075
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_199141.2
Sequence length
3295.0 nt
GC content
0.6149

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1379.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1435.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 669.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370088.1 NCBI
CUCGGCCUGCACGGCGGCUGCGGCGGCGGUAGCGGCAGCGGCGGCGGCG… 3226 nt 0.6159
NM_001370089.1 NCBI
GAGUACCGAGUUCCACCGCUGUGCGAGGUGUGGCGUUCAGGACCCCCGA… 3020 nt 0.5907
NM_199141.2 NCBI
CUCGGCCUGCACGGCGGCUGCGGCGGCGGUAGCGGCAGCGGCGGCGGCG… 3295 nt 0.6149
Summary

This gene belongs to the protein arginine methyltransferase (PRMT) family. The encoded enzyme catalyzes the methylation of guanidino nitrogens of arginyl residues of proteins. The enzyme acts specifically on histones and other chromatin-associated proteins and is involved in regulation of gene expression. The enzyme may act in association with other proteins or within multi-protein complexes and may play a role in cell type-specific functions and cell lineage specification. A related pseudogene is located on chromosome 9. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A study in human patients with acute myocardial infarction identified CARM1 as a key hub gene involved in disease progression, where it was significantly negatively correlated with hematopoietic stem cell types and positively correlated with T cells and B cells [Song et al. DOI:10.3389/fpubh.2022.894129].