Basic Information
Symbol
CASC4
RNA class
mRNA
Alias
Golgi Membrane Protein 2
CASC4
H63
Cancer Susceptibility Candidate Gene 4 Protein
Cancer Susceptibility Candidate 4
Cancer Susceptibility 4
DKFZp459F1927
Protein GOLM2
Gene Associated With HER-2/Neu Overexpression
Protein CASC4
Location (GRCh38)
15:44288699-44415758
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_138423.4
Sequence length
3974.0 nt
GC content
0.4084
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1089.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1170.45 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1054.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
The increased expression level of this gene is associated with HER-2/neu proto-oncogene overexpression. Amplification and resulting overexpression of this proto-oncogene are found in approximately 30% of human breast and 20% of human ovarian cancers. Alternatively spliced variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]
Forensic Context
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