Basic Information

Symbol
CASP10
RNA class
mRNA
Alias
Caspase 10 MCH4 FAS-Associated Death Domain Protein Interleukin-1B-Converting Enzyme 2 FLICE-2 Caspase 10, Apoptosis-Related Cysteine Protease ICE-Like Apoptotic Protease 4 Caspase-10 CASP-10 FLICE2 Caspase 10, Apoptosis-Related Cysteine Peptidase Caspase 10 Apoptosis-Related Cysteine Peptidase Interleukin-1B-Converting Enzyme 2 Apoptotic Protease MCH-4 Apoptotic Protease Mch-4 FADD-Like ICE2 EC 3.4.22.63 ALPS2
Location (GRCh38)
2:201182693-201229428
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032977.4
Sequence length
5668.0 nt
GC content
0.4614

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1861.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1958.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1493.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206524.2 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 5467 nt 0.4597
NM_001206542.2 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 1935 nt 0.4703
NM_001230.5 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 5539 nt 0.4606
NM_001306083.2 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 1146 nt 0.4511
NM_032974.5 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 2064 nt 0.4719
NM_032976.4 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 5576 nt 0.4605
NM_032977.4 NCBI
AGUUUUCACUUAAACAACCAGCAAGUCUUGAAGUCUCUUCCCAAGCAAA… 5668 nt 0.4614
Summary

This gene encodes a protein which is a member of the cysteine-aspartic acid protease (caspase) family. Sequential activation of caspases plays a central role in the execution-phase of cell apoptosis. Caspases exist as inactive proenzymes which undergo proteolytic processing at conserved aspartic residues to produce two subunits, large and small, that dimerize to form the active enzyme. This protein cleaves and activates caspases 3 and 7, and the protein itself is processed by caspase 8. Mutations in this gene are associated with type IIA autoimmune lymphoproliferative syndrome, non-Hodgkin lymphoma and gastric cancer. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2011]

Forensic Context

A study in human cadaver liver tissues demonstrated that the CASP10 was up-regulated (2.0154 fold) in decaying tissues compared to a control [Javan et al. DOI:10.1007/S12024-015-9704-6]. In human postmortem prostate tissues, the CASP10 was not overly expressed at lower postmortem intervals but showed increased expression at longer intervals of 96 and 120 hours [Tolbert et al. DOI:10.1016/j.gene.2018.06.090].