Basic Information

Symbol
ACSL6
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Synthetase Long Chain Family Member 6 LACS5 ACS2 KIAA0837 LACS2 FACL6 Fatty-Acid-Coenzyme A Ligase, Long-Chain 6 Long-Chain-Fatty-Acid--CoA Ligase 6 Arachidonate--CoA Ligase EC 6.2.1.3 LACS 6 Long Fatty Acyl-CoA Synthetase 2 Long-Chain Acyl-CoA Synthetase 6 EC 6.2.1.15 EC 6.2.1
Location (GRCh38)
5:131949973-132012243
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001009185.3
Sequence length
6535.0 nt
GC content
0.4075

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1992.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2123.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1721.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001405490.1 NCBI
GCCCGGGAGCUUGGCGGUUCCGACACCGCGAGUUUGUCCUCUCACUUCU… 6186 nt 0.3949
NM_015256.4 NCBI
AGCGGCGGCGGCGGCGCGGCUACUGCUGGGGCUGCUGGGCUGCGGGGCU… 6535 nt 0.4077
Showing 21 to 22 of 22 entries
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the formation of acyl-CoA from fatty acids, ATP, and CoA, using magnesium as a cofactor. The encoded protein plays a major role in fatty acid metabolism in the brain. Translocations with the ETV6 gene are causes of myelodysplastic syndrome with basophilia, acute myelogenous leukemia with eosinophilia, and acute eosinophilic leukemia. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Apr 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.