Basic Information

Symbol
CASP3
RNA class
mRNA
Alias
Caspase 3 Apopain CPP32 CPP32B Caspase 3, Apoptosis-Related Cysteine Peptidase Caspase 3, Apoptosis-Related Cysteine Protease SREBP Cleavage Activity 1 Cysteine Protease CPP32 Protein Yama EC 3.4.22.56 Caspase-3 CASP-3 CPP-32 SCA-1 Yama PARP Cleavage Protease Procaspase3 EC 3.4.22
Location (GRCh38)
4:184627695-184650418
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004346.4
Sequence length
2645.0 nt
GC content
0.3943

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-703.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -756.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 652.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001354777.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2607 nt 0.3909
NM_001354779.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2474 nt 0.3804
NM_001354780.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2641 nt 0.3945
NM_001354781.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2357 nt 0.3734
NM_001354782.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2524 nt 0.3887
NM_001354783.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2716 nt 0.3951
NM_001354784.2 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2353 nt 0.3736
NM_004346.4 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2645 nt 0.3943
NM_032991.3 NCBI
AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2478 nt 0.3801
Summary

The protein encoded by this gene is a cysteine-aspartic acid protease that plays a central role in the execution-phase of cell apoptosis. The encoded protein cleaves and inactivates poly(ADP-ribose) polymerase while it cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins as well as caspases 6, 7, and 9. This protein itself is processed by caspases 8, 9, and 10. It is the predominant caspase involved in the cleavage of amyloid-beta 4A precursor protein, which is associated with neuronal death in Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the CASP3 mRNA level significantly increased (2.1 ± 0.4 folds) on day 3 post-wounding, with protein positivity up to 10% at 24h and 10-30% on day 3, showing time-dependent expression useful for wound age estimation [Akar et al. DOI:10.1515/tjb-2017-0131]. Immunohistochemistry results were consistent with mRNA data, and the TUNEL assay confirmed increased apoptotic cells during peak caspase expression periods.