Basic Information

Symbol
CAV2
RNA class
mRNA
Alias
Caveolin 2 CAV Caveolin-2 Caveolae Protein, 20-KD
Location (GRCh38)
7:116287380-116508541
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001233.5
Sequence length
2953.0 nt
GC content
0.3630

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-727.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -788.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 679.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206747.2 NCBI
GCACCGCGCCAGCCGGGCUGCAGCGGCCGCGCACCAAGGCUGCGAUGGG… 2953 nt 0.3630
NM_001206748.2 NCBI
GAGACCCGCACCCUUCCCCGGUCCCACCCGUCACCAGGCCGCCCGCGUA… 2973 nt 0.3653
NM_001233.5 NCBI
GCACCGCGCCAGCCGGGCUGCAGCGGCCGCGCACCAAGGCUGCGAUGGG… 2953 nt 0.3630
NM_198212.3 NCBI
GCACCGCGCCAGCCGGGCUGCAGCGGCCGCGCACCAAGGCUGCGAUGGG… 2765 nt 0.3519
Summary

The protein encoded by this gene is a major component of the inner surface of caveolae, small invaginations of the plasma membrane, and is involved in essential cellular functions, including signal transduction, lipid metabolism, cellular growth control and apoptosis. This protein may function as a tumor suppressor. This gene and related family member (CAV1) are located next to each other on chromosome 7, and express colocalizing proteins that form a stable hetero-oligomeric complex. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. Additional isoforms resulting from the use of alternate in-frame translation initiation codons have also been described, and shown to have preferential localization in the cell (PMID:11238462). [provided by RefSeq, May 2011]

Forensic Context

A systematic review of postmortem human brain studies found that the CAV2 mRNA, a connexin-binding partner, exhibited decreased transcription in the anterior cingulate cortex of individuals who died by suicide compared to controls [Yamamoto et al. DOI:10.3390/Ijms25115750].