Basic Information

Symbol
CAVIN2
RNA class
mRNA
Alias
Caveolae Associated Protein 2 Cavin-2 PS-P68 SDPR SDR Phosphatidylserine-Binding Protein Serum Deprivation-Response Protein Caveolae-Associated Protein 2 Serum Deprivation Response Serum Deprivation Response (Phosphatidylserine-Binding Protein) Serum Deprivation Response (Phosphatidylserine Binding Protein) Phosphatidylserine Binding Protein
Location (GRCh38)
2:191834305-191847211
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004657.6
Sequence length
3054.0 nt
GC content
0.4286

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-837.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -897.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 652.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004657.6 NCBI
GAUCAGCGUAGCCAGUUGUUGCCUGUCUGAACCUCUGCCAGUCCUGGAG… 3054 nt 0.4286
Summary

This gene encodes a calcium-independent phospholipid-binding protein whose expression increases in serum-starved cells. This protein is a substrate for protein kinase C (PKC) phosphorylation and recruits polymerase I and transcript release factor (PTRF) to caveolae. Removal of this protein causes caveolae loss and its over-expression results in caveolae deformation and membrane tubulation.[provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in humans with severe erectile dysfunction using single-cell RNA sequencing of penile cavernous tissue identified CAVIN2 as a gene expressed in endothelial cell subpopulations that regulates the formation of caveolae [Fang et al. DOI:10.3389/fendo.2022.874915]. In a separate human study of major trauma patients, the CAVIN2 was significantly downregulated in circulating T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].