Basic Information

Symbol
CBLN2
RNA class
mRNA
Alias
Cerebellin 2 Precursor Cerebellin-2
Location (GRCh38)
18:72534118-72638521
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182511.4
Sequence length
2747.0 nt
GC content
0.4885

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-931.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -984.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 762.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_182511.4 NCBI
AGUCCGAGGUCCAGAGGAGCAGACACACAGACCCGGGCCGGAGGCCCCU… 2747 nt 0.4885
Summary

Predicted to be involved in maintenance of synapse structure and spontaneous synaptic transmission. Predicted to act upstream of or within positive regulation of synapse assembly. Predicted to be located in synaptic cleft. Predicted to be part of trans-synaptic protein complex. Predicted to be active in glutamatergic synapse. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the CBLN2 as a marker for excitatory neurons, used for manual annotation of excitatory neuron clusters in an Alzheimer's disease dataset during single-nucleus RNA sequencing analysis [Xue et al. DOI:10.3233/JAD-230559].