Basic Information

Symbol
CBR1
RNA class
mRNA
Alias
Carbonyl Reductase 1 SDR21C1 CBR Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 21C Member 1 20-Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase NADPH-Dependent Carbonyl Reductase 1 Alcohol Dehydrogenase [NAD(P)+] CBR1 Prostaglandin-E(2) 9-Reductase Prostaglandin 9-Ketoreductase Carbonyl Reductase [NADPH] 1 EC 1.1.1.184 PG-9-KR Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 21C, Member 1 15-Hydroxyprostaglandin Dehydrogenase [NADP(+)] Epididymis Secretory Sperm Binding Protein 15-Hydroxyprostaglandin Dehydrogenase Carbonyl Reductase (NADPH) 1 EC 1.1.1.196 EC 1.1.1.197 EC 1.1.1.189 EC 1.1.1.71 HCBR1 CRN
Location (GRCh38)
21:36069941-36073166
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001757.4
Sequence length
1208.0 nt
GC content
0.5414

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-446.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -467.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286789.2 NCBI
AGACUCGAGCAGUCUCUGGAACACGCUGCGGGGCUCCCGGGCCUGAGCC… 1839 nt 0.5079
NM_001757.4 NCBI
AGACUCGAGCAGUCUCUGGAACACGCUGCGGGGCUCCCGGGCCUGAGCC… 1208 nt 0.5414
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family, which function as NADPH-dependent oxidoreductases having wide specificity for carbonyl compounds, such as quinones, prostaglandins, and various xenobiotics. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CBR1 was downregulated in common in spleen leukocytes across all three injury models of trauma/hemorrhage, burn injury, and LPS infusion at 2 hours post-injury [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005]. In human burn patients, the CBR1 was identified as one of 19 center genes commonly differentially expressed in blood across early-stage, middle-stage, and control comparisons, associating it with burn injury progression [Wu et al. DOI:10.007/s10753-018-0829-0].