Basic Information

Symbol
CCDC13
RNA class
mRNA
Alias
Coiled-Coil Domain Containing 13 Coiled-Coil Domain-Containing Protein 13 FLJ25467
Location (GRCh38)
3:42705756-42773253
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_144719.4
Sequence length
5456.0 nt
GC content
0.5555

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2122.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2211.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1250.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_144719.4 NCBI
AGGGCAGCGCGUGUCGGCGUCCGGAGGAGGUGACCUAGCCGCCGCGGUC… 5456 nt 0.5555
Summary

Acts upstream of or within DNA damage response; cytoplasmic microtubule organization; and non-motile cilium assembly. Located in centriolar satellite. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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