Basic Information

Symbol
CCDC66
RNA class
mRNA
Alias
Coiled-Coil Domain Containing 66 Coiled-Coil Domain-Containing Protein 66 DKFZp686C0433
Location (GRCh38)
3:56557161-56621837
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001141947.3
Sequence length
3134.0 nt
GC content
0.3772

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-677.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -736.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1000.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001012506.5 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3145 nt 0.3755
NM_001141947.3 NCBI
GAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGGGGCUUGAGCGUUCUGUGGA… 3134 nt 0.3772
NM_001353147.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3182 nt 0.3771
NM_001353148.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3146 nt 0.3757
NM_001353149.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3143 nt 0.3767
NM_001353150.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3095 nt 0.3758
NM_001353151.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3138 nt 0.3779
NM_001353152.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3315 nt 0.3774
NM_001353153.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3174 nt 0.3774
NM_001353154.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3035 nt 0.3740
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

Enables microtubule binding activity. Involved in several processes, including ciliary transition zone assembly; microtubule cytoskeleton organization; and mitotic metaphase chromosome alignment. Located in several cellular components, including Flemming body; cytoskeleton; and photoreceptor inner segment. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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