Basic Information

Symbol
CCDC66
RNA class
mRNA
Alias
Coiled-Coil Domain Containing 66 Coiled-Coil Domain-Containing Protein 66 DKFZp686C0433
Location (GRCh38)
3:56557161-56621837
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001141947.3
Sequence length
3134.0 nt
GC content
0.3772

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-677.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -736.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1000.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001353155.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3014 nt 0.3739
NM_001353156.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3256 nt 0.3793
NM_001353158.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3225 nt 0.3833
NM_001353160.1 NCBI
AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… 3337 nt 0.3752
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary

Enables microtubule binding activity. Involved in several processes, including ciliary transition zone assembly; microtubule cytoskeleton organization; and mitotic metaphase chromosome alignment. Located in several cellular components, including Flemming body; cytoskeleton; and photoreceptor inner segment. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.