Basic Information

Symbol
CCNJL
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin J Like Cyclin-J-Like Protein FLJ14166 Cyclin J-Like
Location (GRCh38)
5:160249083-160345396
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001308173.3
Sequence length
5709.0 nt
GC content
0.5062

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1983.07 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2083.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1496.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308173.3 NCBI
GGGAGCCUGCGAGCCGCGGCGGGACCCGAGCGCACGCAGGGGCGCGGCG… 5709 nt 0.5062
NM_024565.8 NCBI
GGGAGCCUGCGAGCCGCGGCGGGACCCGAGCGCACGCAGGGGCGCGGCG… 5853 nt 0.5081
Summary

Predicted to enable cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity. Predicted to be involved in G1/S transition of mitotic cell cycle. Predicted to be part of cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex. Predicted to be active in cytoplasm; microtubule organizing center; and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the CCNJL as a differentially expressed gene downregulated in left ventricular tissue from animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].