Basic Information

Symbol
CCR3
RNA class
mRNA
Alias
C-C Motif Chemokine Receptor 3 CC-CKR-3 CKR3 CMKBR3 CD193 Chemokine (C-C Motif) Receptor 3 C-C Chemokine Receptor Type 3 Eosinophil Eotaxin Receptor C-C CKR-3 C C CKR3 CKR 3 CCR-3 Eosinophil CC Chemokine Receptor 3 CC Chemokine Receptor 3 B-Chemokine Receptor CD193 Antigen
Location (GRCh38)
3:46130890-46266706
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_178329.3
Sequence length
1638.0 nt
GC content
0.4536

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-469.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -501.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164680.2 NCBI
ACCACUGGUCUUCUUGUGCUUAUCCGGGCAAGAACUUAUCGAAAUACAA… 1698 nt 0.4529
NM_001837.4 NCBI
ACCACUGGUCUUCUUGUGCUUAUCCGGGCAAGAACUUAUCGAAAUACAA… 1717 nt 0.4502
NM_178328.1 NCBI
CUGAUGGUAUCUCUGUUUCAGGAGUGGUGACGCCUAAGCUAUCACUGGA… 1786 nt 0.4524
NM_178329.3 NCBI
ACCACUGGUCUUCUUGUGCUUAUCCGGGCAAGAACUUAUCGAAAUACAA… 1638 nt 0.4536
Summary

The protein encoded by this gene is a receptor for C-C type chemokines. It belongs to family 1 of the G protein-coupled receptors. This receptor binds and responds to a variety of chemokines, including eotaxin (CCL11), eotaxin-3 (CCL26), MCP-3 (CCL7), MCP-4 (CCL13), and RANTES (CCL5). It is highly expressed in eosinophils and basophils, and is also detected in TH1 and TH2 cells, as well as in airway epithelial cells. This receptor may contribute to the accumulation and activation of eosinophils and other inflammatory cells in the allergic airway. It is also known to be an entry co-receptor for HIV-1. This gene and seven other chemokine receptor genes form a chemokine receptor gene cluster on the chromosomal region 3p21. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in humans identified the CCR3 as a key immune-related gene and potential biomarker for burn injury, where it was significantly down-regulated in burn patients compared to controls in both external dataset validation and qRT-PCR analysis of clinical blood samples [Niu et al. DOI:10.1093/jbcr/irad050].