Basic Information

Symbol
CCR7
RNA class
mRNA
Alias
C-C Motif Chemokine Receptor 7 CDw197 BLR2 CMKBR7 CD197 EBI1 Epstein-Barr Virus-Induced G-Protein Coupled Receptor 1 Chemokine (C-C Motif) Receptor 7 C-C Chemokine Receptor Type 7 MIP-3 Beta Receptor CC-CKR-7 CCR-7 Lymphocyte-Specific G Protein-Coupled Peptide Receptor EBV-Induced G Protein-Coupled Receptor 1 EBV-Induced G-Protein Coupled Receptor 1 Epstein-Barr Virus Induced Gene 1 Bukitt'S Lymphoma Receptor 2 CC Chemokine Receptor 7 CD197 Antigen C-C CKR-7 EVI1
Location (GRCh38)
17:40551081-40565472
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001838.4
Sequence length
2173.0 nt
GC content
0.5504

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-795.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -829.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001301714.2 NCBI
AGACAGGGGUAGUGCGAGGCCGGGCACAGCCUUCCUGUGUGGUUUUACC… 2123 nt 0.5516
NM_001301716.2 NCBI
CUCUAGAUGAGUCAGUGGAGGGCGGGUGGAGCGUUGAACCGUGAAGAGU… 2435 nt 0.5507
NM_001301717.2 NCBI
CUCUAGAUGAGUCAGUGGAGGGCGGGUGGAGCGUUGAACCGUGAAGAGU… 2191 nt 0.5477
NM_001301718.2 NCBI
AGGAGAAGGUGCCUUAAACAGGUUCCCACGCAUUUCCUGGCGCUAUUGA… 2281 nt 0.5506
NM_001838.4 NCBI
AGACAGGGGUAGUGCGAGGCCGGGCACAGCCUUCCUGUGUGGUUUUACC… 2173 nt 0.5504
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the G protein-coupled receptor family. This receptor was identified as a gene induced by the Epstein-Barr virus (EBV), and is thought to be a mediator of EBV effects on B lymphocytes. This receptor is expressed in various lymphoid tissues and activates B and T lymphocytes. It has been shown to control the migration of memory T cells to inflamed tissues, as well as stimulate dendritic cell maturation. The chemokine (C-C motif) ligand 19 (CCL19/ECL) has been reported to be a specific ligand of this receptor. Signals mediated by this receptor regulate T cell homeostasis in lymph nodes, and may also function in the activation and polarization of T cells, and in chronic inflammation pathogenesis. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2014]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that blast wave exposure induced a time- and intensity-dependent upregulation of the CCR7 mRNA in whole brains, with increased expression observed within 2 hours after a 5 psi exposure that remained elevated, and augmented duration and magnitude of upregulation after 10–11 psi exposures [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001]. In mice, the CCR7 was highly expressed in heart-associated B-cells (hB) and was characteristic of naïve T-cell clusters following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].