Basic Information

Symbol
CCT3
RNA class
mRNA
Alias
Chaperonin Containing TCP1 Subunit 3 TRIC5 Cctg Chaperonin Containing T-Complex Polypeptide 1 Subunit 3 Chaperonin Containing TCP1, Subunit 3 (Gamma) T-Complex Protein 1 Subunit Gamma TCP-1-Gamma CCT-Gamma HTRiC5 TCP1 (T-Complex-1) Ring Complex, Polypeptide 5 T-Complex Protein 1, Gamma Subunit EC 3.6.1.- NEDSVH PIG48 CCTG
Location (GRCh38)
1:156308960-156367873
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005998.5
Sequence length
1977.0 nt
GC content
0.5063

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -700.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 540.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008800.3 NCBI
GUAAGCCCUGAGGAGGCAGCGUUUUCUGGGCUUCUGUCUGGUUCUCUCU… 1863 nt 0.5094
NM_005998.5 NCBI
GUAAGCCCUGAGGAGGCAGCGUUUUCUGGGCUUCUGUCUGGUUCUCUCU… 1977 nt 0.5063
Summary

The protein encoded by this gene is a molecular chaperone that is a member of the chaperonin containing TCP1 complex (CCT), also known as the TCP1 ring complex (TRiC). This complex consists of two identical stacked rings, each containing eight different proteins. Unfolded polypeptides enter the central cavity of the complex and are folded in an ATP-dependent manner. The complex folds various proteins, including actin and tubulin. Alternate transcriptional splice variants have been characterized for this gene. In addition, a pseudogene of this gene has been found on chromosome 8. [provided by RefSeq, Aug 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.