Basic Information

Symbol
ACTN3
RNA class
mRNA
Alias
Actinin Alpha 3 F-Actin Cross-Linking Protein Alpha-Actinin-3 Alpha-Actinin Skeletal Muscle Isoform 3 Actinin Alpha 3 (Gene/Pseudogene) Alpha-Actinin Skeletal Muscle Actinin, Alpha 3 ACTN3D
Location (GRCh38)
11:66546395-66563334
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001104.4
Sequence length
2882.0 nt
GC content
0.5992

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1136.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1187.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 725.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001104.4 NCBI
GUGCCGAGCGGAGCGAAGCCAGGAGCCCGAUCGAGAUGAUGAUGGUUAU… 2882 nt 0.5992
NM_001258371.3 NCBI
AAUAGCCCUGCCGCAGCCCAUCCAGCUGGCUCAGAGCCGUUCCCCAUGC… 3092 nt 0.5951
Summary

This gene encodes a member of the alpha-actin binding protein gene family. The encoded protein is primarily expressed in skeletal muscle and functions as a structural component of sarcomeric Z line. This protein is involved in crosslinking actin containing thin filaments. An allelic polymorphism in this gene results in both coding and non-coding variants; the reference genome represents the coding allele. The non-functional allele of this gene is associated with elite athlete status. [provided by RefSeq, Apr 2024]

Forensic Context

A study in human skeletal muscle demonstrated that the protein marker alpha-actinin does not generate degradation products until late post-mortem intervals, indicating its relative stability in the early phases of decomposition [Lopez et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2025.112412].