Basic Information

Symbol
CD22
RNA class
mRNA
Alias
CD22 Molecule SIGLEC2 CD22 Antigen SIGLEC-2 Sialic Acid-Binding Ig-Like Lectin 2 B-Lymphocyte Cell Adhesion Molecule T-Cell Surface Antigen Leu-14 B-Cell Receptor CD22 BL-CAM Sialic Acid Binding Ig-Like Lectin 2 Siglec-2
Location (GRCh38)
19:35319261-35347361
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001771.4
Sequence length
3274.0 nt
GC content
0.5513

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1140.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1201.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 651.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001185099.2 NCBI
AGAUGCUGCCAGGGUCCCUGAAGAGGGAAGACACGCGGAAACAGGCUUG… 3010 nt 0.5528
NM_001185100.2 NCBI
AGAUGCUGCCAGGGUCCCUGAAGAGGGAAGACACGCGGAAACAGGCUUG… 3155 nt 0.5512
NM_001185101.2 NCBI
AGAUGCUGCCAGGGUCCCUGAAGAGGGAAGACACGCGGAAACAGGCUUG… 2743 nt 0.5516
NM_001278417.2 NCBI
AGAUGCUGCCAGGGUCCCUGAAGAGGGAAGACACGCGGAAACAGAAUAC… 3099 nt 0.5521
NM_001771.4 NCBI
AGAUGCUGCCAGGGUCCCUGAAGAGGGAAGACACGCGGAAACAGGCUUG… 3274 nt 0.5513
Summary

Predicted to enable CD4 receptor binding activity; protein phosphatase binding activity; and sialic acid binding activity. Involved in B cell activation; negative regulation of B cell receptor signaling pathway; and regulation of endocytosis. Located in early endosome and recycling endosome. Implicated in diffuse large B-cell lymphoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in zebrafish and mice demonstrated that the CD22 transcript, associated with innate immunity, exhibited a significant increase in relative abundance within 1 hour postmortem in mouse tissues [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].