Basic Information

Symbol
CD24
RNA class
mRNA
Alias
CD24 Molecule CD24A CD24 Antigen (Small Cell Lung Carcinoma Cluster 4 Antigen) Signal Transducer CD24 Small Cell Lung Carcinoma Cluster 4 Antigen CD24 Antigen
Location (GRCh38)
6:106969831-106975627
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001359084.1
Sequence length
2156.0 nt
GC content
0.4109

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-563.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -600.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291737.1 NCBI
AGUUUGCAGCGUCAGGCAGCGGGUCUGCGCCCAGCGAGCGGCUCCCCAG… 2440 nt 0.4504
NM_001291738.1 NCBI
UGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAAUGCAAUGGCCUGAUCUCUGCUCACUG… 2295 nt 0.4222
NM_001291739.1 NCBI
CUUUUUAAACAAACCCCGGUUCCGGGCUGAAGCCGAGGCGGGGACCCUC… 2374 nt 0.4301
NM_001359084.1 NCBI
ACCUUGCCUGCGCCCGCCCGGAGCCAGCGGUUCUCCAAGCACCCAGCAU… 2156 nt 0.4109
NM_013230.3 NCBI
GCGCGCAGAUCGCUCCGGACCCGGACACCGCCUGCGAGGAGCGCCGACC… 2513 nt 0.4584
Summary

This gene encodes a sialoglycoprotein that is expressed on mature granulocytes and B cells and modulates growth and differentiation signals to these cells. The precursor protein is cleaved to a short 32 amino acid mature peptide which is anchored via a glycosyl phosphatidylinositol (GPI) link to the cell surface. This gene was missing from previous genome assemblies, but is properly located on chromosome 6. Non-transcribed pseudogenes have been designated on chromosomes 1, 15, 20, and Y. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.