Basic Information

Symbol
CD244
RNA class
mRNA
Alias
CD244 Molecule NKR2B4 SLAMF4 NAIL 2B4 Natural Killer Cell Receptor 2B4 Nmrk CD244 Molecule, Natural Killer Cell Receptor 2B4 Signaling Lymphocytic Activation Molecule 4 NK Cell Type I Receptor Protein 2B4 NK Cell Activation-Inducing Ligand SLAM Family Member 4 H2B4 NK Cell Activation Inducing Ligand NAIL CD244 Natural Killer Cell Receptor 2B4 CD244 Antigen
Location (GRCh38)
1:160830160-160862904
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016382.4
Sequence length
2495.0 nt
GC content
0.4878

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-848.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -897.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 749.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166663.2 NCBI
AGACCAGCUCCAGGCGCUGGGGCUUUCUCAGUGGCCUUGUCAGCUCACA… 2510 nt 0.4876
NM_001166664.2 NCBI
AGACCAGCUCCAGGCGCUGGGGCUUUCUCAGUGGCCUUGUCAGCUCACA… 2219 nt 0.4826
NM_016382.4 NCBI
AGACCAGCUCCAGGCGCUGGGGCUUUCUCAGUGGCCUUGUCAGCUCACA… 2495 nt 0.4878
Summary

This gene encodes a cell surface receptor expressed on natural killer (NK) cells (and some T cells) that mediate non-major histocompatibility complex (MHC) restricted killing. The interaction between NK-cell and target cells via this receptor is thought to modulate NK-cell cytolytic activity. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CD244 transcript, an innate immunity protein, increased in relative abundance within 1 hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].