Basic Information

Symbol
CD28
RNA class
mRNA
Alias
CD28 Molecule T-Cell-Specific Surface Glycoprotein CD28 T-Cell-Specific Surface Glycoprotein CD28 Antigen (Tp44) CD28 Antigen IMD123 Tp44 TP44
Location (GRCh38)
2:203706517-203739756
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006139.4
Sequence length
4721.0 nt
GC content
0.4228

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1393.54 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1485.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1359.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001243077.2 NCBI
ACACUUCGGGUUCCUCGGGGAGGAGGGGCUGGAACCCUAGCCCAUCGUC… 4430 nt 0.4233
NM_001243078.2 NCBI
ACACUUCGGGUUCCUCGGGGAGGAGGGGCUGGAACCCUAGCCCAUCGUC… 4364 nt 0.4223
NM_001410981.1 NCBI
AUCAAAACAACGUUAUAUCCUGUGUGAAAUGCUGCAGUCAGGAUGCCUU… 4747 nt 0.4234
NM_006139.4 NCBI
ACACUUCGGGUUCCUCGGGGAGGAGGGGCUGGAACCCUAGCCCAUCGUC… 4721 nt 0.4228
Summary

The protein encoded by this gene is essential for T-cell proliferation and survival, cytokine production, and T-helper type-2 development. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jul 2011]

Forensic Context

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