Basic Information
Symbol
ACTR1A
RNA class
mRNA
Alias
Actin Related Protein 1A
ARP1
Arp1A
ARP1 Actin-Related Protein 1 Homolog A, Centractin Alpha
ARP1 Actin Related Protein 1 Homolog A
Centrosome-Associated Actin Homolog
Alpha-Centractin
Centractin
Actin-RPV
CTRN1
ARP1 (Actin-Related Protein 1, Yeast) Homolog A (Centractin Alpha)
Epididymis Secretory Sperm Binding Protein
Centractin Alpha
Location (GRCh38)
10:102461881-102502744
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_005736.4
Sequence length
2830.0 nt
GC content
0.5505
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1054.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1103.72 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
648.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUCAGUGGCGCUAGCGGCGGACCCGGCUGGGCAGUUCCUUCCCCAGAAG… | 2830 nt | 0.5505 |
Summary
This gene encodes a 42.6 kD subunit of dynactin, a macromolecular complex consisting of 10-11 subunits ranging in size from 22 to 150 kD. Dynactin binds to both microtubules and cytoplasmic dynein. It is involved in a diverse array of cellular functions, including ER-to-Golgi transport, the centripetal movement of lysosomes and endosomes, spindle formation, chromosome movement, nuclear positioning, and axonogenesis. This subunit is present in 8-13 copies per dynactin molecule, and is the most abundant molecule in the dynactin complex. It is an actin-related protein, and is approximately 60% identical at the amino acid level to conventional actin. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.