Basic Information

Symbol
CD5
RNA class
mRNA
Alias
CD5 Molecule LEU1 T1 T-Cell Surface Glycoprotein CD5 Lymphocyte Antigen T1/Leu-1 CD5 Antigen (P56-62) Epididymis Secretory Sperm Binding Protein CD5 Antigen
Location (GRCh38)
11:61102489-61127852
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014207.4
Sequence length
3127.0 nt
GC content
0.5753

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1196.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1251.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 623.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001346456.2 NCBI
GAGUCUUGCUGAUGCUCCCGGCUGAAUAAACCCCUUCCUUCUUUAACUU… 3354 nt 0.5713
NM_014207.4 NCBI
GAGAUACCCGGCCAGACACCCUCACCUGCGGUGCCCAGCUGCCCAGGCU… 3127 nt 0.5753
Summary

This gene encodes a member of the scavenger receptor cysteine-rich (SRCR) superfamily. Members of this family are secreted or membrane-anchored proteins mainly found in cells associated with the immune system. This protein is a type-I transmembrane glycoprotein found on the surface of thymocytes, T lymphocytes and a subset of B lymphocytes. The encoded protein contains three SRCR domains and may act as a receptor to regulate T-cell proliferation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Oct 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.