Basic Information

Symbol
CD55
RNA class
mRNA
Alias
CD55 Molecule (Cromer Blood Group) CR CROM DAF TC CD55 Molecule, Decay Accelerating Factor For Complement (Cromer Blood Group) Complement Decay-Accelerating Factor CD55 Antigen Decay Accelerating Factor For Complement (CD55, Cromer Blood Group System) Cromer Blood Group Antigen Rh Blood Group D Antigen CHAPLE
Location (GRCh38)
1:207321514-207386804
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000574.5
Sequence length
2590.0 nt
GC content
0.3915

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-665.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -719.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 801.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000574.5 NCBI
CUGCUUACUGCAACUCGCUCCGGCCGCUGGGCGUAGCUGCGACUCGGCG… 2590 nt 0.3915
NM_001114752.3 NCBI
CUGCUUACUGCAACUCGCUCCGGCCGCUGGGCGUAGCUGCGACUCGGCG… 2708 nt 0.3988
NM_001300902.2 NCBI
CUGCUUACUGCAACUCGCUCCGGCCGCUGGGCGUAGCUGCGACUCGGCG… 1545 nt 0.4783
NM_001300903.2 NCBI
CUGCUUACUGCAACUCGCUCCGGCCGCUGGGCGUAGCUGCGACUCGGCG… 2705 nt 0.4004
NM_001300904.2 NCBI
CUGCUUACUGCAACUCGCUCCGGCCGCUGGGCGUAGCUGCGACUCGGCG… 2683 nt 0.3932
Summary

This gene encodes a glycoprotein involved in the regulation of the complement cascade. Binding of the encoded protein to complement proteins accelerates their decay, thereby disrupting the cascade and preventing damage to host cells. Antigens present on this protein constitute the Cromer blood group system (CROM). Alternative splicing results in multiple transcript variants. The predominant transcript variant encodes a membrane-bound protein, but alternatively spliced transcripts may produce soluble proteins. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

A study in C. elegans demonstrated that the intracellular receptor DAF-12 biochemically binds specific genomic response elements to regulate numerous target genes, with in vitro genomic selection identifying 26 distinct binding fragments and quantitative PCR confirming DAF-12-dependent regulation of at least 40 target genes, showing stage-specific and program-specific roles in reproductive development and dauer formation [Shostak et al. DOI:10.1101/gad.1218504]. A study in mice demonstrated that the protein Calretinin, an interneuron subtype marker, exhibited significantly increased colocalization with the neuronal activation marker c-Fos in the contralateral primary somatosensory cortex one hour after a hind paw burn injury [Erdei et al. DOI:10.3390/ijms26083538].