Basic Information

Symbol
ACTR2
RNA class
mRNA
Alias
Actin Related Protein 2 ARP2 ARP2 Actin Related Protein 2 Homolog Actin-Related Protein 2 Actin-Like Protein 2 ARP2 (Actin-Related Protein 2, Yeast) Homolog ARP2 Actin-Related Protein 2 Homolog (Yeast)
Location (GRCh38)
2:65227745-65271253
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005722.4
Sequence length
3783.0 nt
GC content
0.3746

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-985.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1064.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 828.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005386.3 NCBI
GCAAGAGGAAGAAGAGAAAACGGCCGGGCGGCGGUGGCUGUAGGUUGUG… 3798 nt 0.3739
NM_005722.4 NCBI
GCAAGAGGAAGAAGAGAAAACGGCCGGGCGGCGGUGGCUGUAGGUUGUG… 3783 nt 0.3746
Summary

The specific function of this gene has not yet been determined; however, the protein it encodes is known to be a major constituent of the ARP2/3 complex. This complex is located at the cell surface and is essential to cell shape and motility through lamellipodial actin assembly and protrusion. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human postmortem nucleus accumbens tissue from subjects with alcohol dependence identified the ACTR2 as a target mRNA within a circRNA-miRNA-mRNA interaction network, where it was positively correlated with circRNA-406742 and negatively correlated with miR-1200 [Vornholt et al. DOI:10.1111/Adb.13071].