Basic Information

Symbol
CD5L
RNA class
mRNA
Alias
CD5 Molecule Like Spalpha API6 CD5 Antigen-Like (Scavenger Receptor Cysteine Rich Family) Apoptosis Inhibitor Expressed By Macrophages IgM-Associated Peptide Apoptosis Inhibitor 6 CD5 Antigen-Like CT-2 HAIM Apoptosis Inhibitor Of Macrophage CD5 Molecule-Like SP-ALPHA SP-Alpha PRO229 AIM
Location (GRCh38)
1:157830911-157898256
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005894.3
Sequence length
2204.0 nt
GC content
0.4887

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-748.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -788.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 444.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((...((((((..(((((..............)))))...((..((((...((.(((((....(((.......(((((((((((((((((((((((((......................))))..)).))))(((((((....)))).)))(((....)))..(((((.(((((((...))))))))))))...))))))))))))))))))....))))).)).))))..))))))))...)).))..))))))...)))))(.(((((((.(((((((...((((((((....)))..)))))((....))..(((((...........))))).......(((((.((((((((.((....(((.((((((((..(((((((((((.......((((..(...((((((((((..(........)..))))))))))...)..))))(((((...((....))...))))).((((((.((.(((((((.(((((.((.((((((.....)))))).))))))))...(((((((.(((......))).....((((......(((((((...)))))))......))))(((..(((((((((....)))))...))))..)))((((((.((((((((((((.............(((((.....))).)).))))))).......((((((((...))))))))(((.((((((((.((.(((((..((((((((...((((....)))))))))))).....(((((.((.(((((.((....)))))))((((((.(.((...))).))))))......((((..(((((......)))))...)))).....)).))))).......((((((..(((((((.((((......))))...((((.........((.((((((......((((((((.(((((((((.(..(((.(((((.........)))))..)))..).)))))))))..((((.((((((((((.(((((........((((((((.(((((.......))))).))))))))))))).....((((((((((..((....)).)))).))))))))))))))))...))))((.((((((...)))))))))))))))))))))))))))).)))))))..)))))).))))).)).))))))))..)))..................(((((((((....)))))).)))))))).))))))....((((.((.((((..((((....))))..(((.((...(((.(((((.......))))).)))...)).))).)))).))))))))))))))))))).)).))))))...))).))))))))......)))))....)))...)))....)))))))..))))))))((((.(((((((((((((...(((..(((((..(((((..(((((((((((....((....))....))))))..))))))))))..(((((..........)))))(((((((..(((((....(((((...(.......)...))))).......)))))..))))))).((((((.((...)).)))))).((((.((((.((((((((...((.(((.(((((.(((((((((((((((((((..((((((((((....(((((((....((((((......((.((((..............((((((......)).)))).....)))).))......))))))........((((....)))).((((..(((((..........(((((.(((.((.((((.....((((.((((...))))((((((((........))))))))..((((.(((((.((((....)))).))))).))))))))...))))...)).))).))))))))))..))))...))))))))))...)))))((((((((..(((.((((((((......)))))))).)))...))..))))))...)).))))).)))))))))).)))).))))).)))))))))))))...)))).))))...)))))..))).)))))).))))..)))))))...........)))).))).................((((........))))..))))))).).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((.((((...((((((..(((((..............)))))...((..(({({..((.(((({....{((.,.,,..(((((((((((((((({((((((((........,,.....}}.....||}}..|},}|}{(((((((....)))).))}|{{....))},|{((({.(((((((...))))))))))))}.}))))))))))))))))}.,.))))))).)).))))..))))))))...)).))..))))))...)))))({((((((({{(((({({..((((((((....}}},.|}|}}{{....}},.{{||||,,,,,|,,,|))|,},|||,,,(((((.((((((((,({....(((.((((((((..(((((((((((.......((((..({{,{(((((((((..(........)..))))))))))}}.)..))))(((((...((....))...))))).((((((.,({(((((((,(((((.((.((((((.....)))))).)))))))}...(((((((..,{.{({.{((({.(({,,((..(((((((((({,,,|||||(,,...|||}}}{{{,.{{{|{{(((....))))),,,)))}..})}((((((.((((((((((((.............(((((.....))).)).))))))).......((((((((...)))))))).,..((((((((.((.(((((..((((((((...((((....)))))))))))).....(((((.((.(((((.((....)))))))((((((.(.{{...,,,,))))))....,.((((..(((((......))))).,,)))).,...)).))))).......((((((..(((((((.((((......)))).,.{{{,,,...,{{.((.((((((......((((((((.(((((((((.{..(((.(((((.........)))))..)))..}.))))))))).{(((,,(((((((((({(((((........({((((((.(((((.......))))).))))))))))))).}...((((((((((..{,....,).)))).))))))}))))))))),.,,))){{.((((((...))))))),))))))))))))))}))})),)))))))..)))))).))))).)).))))))))..|||........,.........{||((((((....)))))).}},))))).)))))).{{{(..,.)))}.}})))),|}..})),)}))}.}}}{{{((,{(((((.,.{{{{||,,,.,))}},}).},)})))).,)))))))))))))))))).)).))))))...))).))))))))......)))))....)))...)))....)))))))..))))))))||{,.{({((((((((((...(((..(((((..(((((..(((((((((((,.,.{(....))..}})))))),.,}}}}}))}}...,((({{.,,,,..,,,,,,(((((((..(((((....(((((...{.......}...))))).......)))))..))))))).{(((((.({...}).)))))}.,{||}|,,,.,,,||||,}}}}|.(((.(((((,((({(((((((((((((((..((({{(((((....(((((((...,{(((((......((.((((.,,,....,,,...((((((......)).)))).....)))).))......)))))}........{{((....}))).((((..(((((..........(((((.(((.((.((((.....{(((.((({...})))((((((((........))))))))..((((.(((((.((((....)))).))))).))))))))...))))...)).))).))))))))))..))))...))))))))}),..})))}(((((({(..{((.((((((((......)))))))).)))...}}..))))))..})).))))).)))))))))).)))).))))).)))|}||||||,,.,))))).},.....)))))..))).)))))).))))..)))))})........,,,))))}))}...,,,,,....,....,{{{........||||..,,,)))),......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001347698.2 NCBI
GUCUUUGUCCCUCCUCUUAACAUACUUGCAGCUAAAACUAAAUAUUGCU… 1703 nt 0.5021
NM_005894.3 NCBI
GUCUUUGUCCCUCCUCUUAACAUACUUGCAGCUAAAACUAAAUAUUGCU… 2204 nt 0.4887
Summary

Predicted to be involved in cellular defense response. Predicted to act upstream of or within positive regulation of complement-dependent cytotoxicity and regulation of complement activation. Located in cell surface. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that the CD5L was significantly decreased in response to both sulfur mustard and thermal burn exposures at 7 days postexposure [Price et al. DOI:10.080/15569520903097754].