Basic Information

Symbol
CD82
RNA class
mRNA
Alias
CD82 Molecule TSPAN27 IA4 CD82 Antigen KAI1 ST6 R2 Kangai 1 (Suppression Of Tumorigenicity 6, Prostate; CD82 Antigen (R2 Leukocyte Antigen, Antigen Detected By Monoclonal And Antibody IA4)) Metastasis Suppressor Kangai-1 Inducible Membrane Protein R2 Tetraspanin-27 C33 Antigen Tspan-27 SAR2 Suppressor Of Tumorigenicity 6 Protein Suppression Of Tumorigenicity 6 R2 Leukocyte Antigen GR15 4F9 C33
Location (GRCh38)
11:44564414-44620924
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002231.4
Sequence length
2212.0 nt
GC content
0.5841

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-950.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -985.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 711.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001024844.2 NCBI
GCAGUCCGACGCCGACUGAGGCACGAGCGGGUGACGCUGGGCCUGCAGC… 2137 nt 0.5849
NM_002231.4 NCBI
GCAGUCCGACGCCGACUGAGGCACGAGCGGGUGACGCUGGGCCUGCAGC… 2212 nt 0.5841
Summary

This metastasis suppressor gene product is a membrane glycoprotein that is a member of the transmembrane 4 superfamily. Expression of this gene has been shown to be downregulated in tumor progression of human cancers and can be activated by p53 through a consensus binding sequence in the promoter. Its expression and that of p53 are strongly correlated, and the loss of expression of these two proteins is associated with poor survival for prostate cancer patients. Two alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.