Basic Information

Symbol
CD86
RNA class
mRNA
Alias
CD86 Molecule CD28LG2 B7.2 B7-2 CD86 Antigen (CD28 Antigen Ligand 2, B7-2 Antigen) T-Lymphocyte Activation Antigen CD86 CTLA-4 Counter-Receptor B7.2 FUN-1 BU63 B70 B-Lymphocyte Activation Antigen B7-2 B-Lymphocyte Antigen B7-2 Activation B7-2 Antigen CD86 Antigen CD86 V6 LAB72
Location (GRCh38)
3:122055362-122121139
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_175862.5
Sequence length
2720.0 nt
GC content
0.4338

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-775.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -827.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 838.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206924.2 NCBI
AGUCAUUGCCGAGGAAGGCUUGCACAGGGUGAAAGCUUUGCUUCUCUGC… 2384 nt 0.4337
NM_001206925.2 NCBI
AGUCAUUGCCGAGGAAGGCUUGCACAGGGUGAAAGCUUUGCUUCUCUGC… 2670 nt 0.4330
NM_006889.5 NCBI
AGAAGUUAUUUGGAACCAAGCAAGAGCACUGUCCCUGGCUGUGGUGUUG… 2840 nt 0.4327
NM_175862.5 NCBI
AGUCAUUGCCGAGGAAGGCUUGCACAGGGUGAAAGCUUUGCUUCUCUGC… 2720 nt 0.4338
NM_176892.2 NCBI
AGAAGUUAUUUGGAACCAAGCAAGAGCACUGUCCCUGGCUGUGGUGUUG… 2696 nt 0.4325
Summary

This gene encodes a type I membrane protein that is a member of the immunoglobulin superfamily. This protein is expressed by antigen-presenting cells, and it is the ligand for two proteins at the cell surface of T cells, CD28 antigen and cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4. Binding of this protein with CD28 antigen is a costimulatory signal for activation of the T-cell. Binding of this protein with cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 negatively regulates T-cell activation and diminishes the immune response. Alternative splicing results in several transcript variants encoding different isoforms.[provided by RefSeq, May 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CD86 is expressed higher in microglia compared to monocyte-derived macrophages (MDMs) after spinal cord injury [Stewart et al. DOI:10.1186/s12974-021-02161-8]. In human sepsis research, the CD86 was used as a macrophage marker in single-cell localization analysis, showing a similar expression pattern to the sepsis-associated gene S100A11 [Cao et al. DOI:10.1186/s12865-025-00778-5].