Basic Information

Symbol
CD8B
RNA class
mRNA
Alias
CD8 Subunit Beta T-Cell Surface Glycoprotein CD8 Beta Chain CD8beta CD8B1 Ly-3 LYT3 P37 CD8 Antigen, Beta Polypeptide 1 (P37) CD8b Molecule T Lymphocyte Surface Glycoprotein Beta Chain Ly-3 Homolog (Mouse) Ly-3 Homolog CD8b Antigen LEU2 LY3
Location (GRCh38)
2:86815339-86861934
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004931.5
Sequence length
4794.0 nt
GC content
0.4848

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1644.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1734.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1152.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178100.2 NCBI
AGGUGUCCCGGGCGCGCCACGAUGCGGCCGCGGCUGUGGCUCCUCUUGG… 864 nt 0.5463
NM_004931.5 NCBI
AGGUGUCCCGGGCGCGCCACGAUGCGGCCGCGGCUGUGGCUCCUCUUGG… 4794 nt 0.4848
NM_172101.5 NCBI
AGGUGUCCCGGGCGCGCCACGAUGCGGCCGCGGCUGUGGCUCCUCUUGG… 1045 nt 0.5474
NM_172102.5 NCBI
AGGUGUCCCGGGCGCGCCACGAUGCGGCCGCGGCUGUGGCUCCUCUUGG… 901 nt 0.5494
NM_172213.5 NCBI
AGGUGUCCCGGGCGCGCCACGAUGCGGCCGCGGCUGUGGCUCCUCUUGG… 991 nt 0.5570
Summary

The CD8 antigen is a cell surface glycoprotein found on most cytotoxic T lymphocytes that mediates efficient cell-cell interactions within the immune system. The CD8 antigen, acting as a coreceptor, and the T-cell receptor on the T lymphocyte recognize antigens displayed by an antigen presenting cell (APC) in the context of class I MHC molecules. The functional coreceptor is either a homodimer composed of two alpha chains, or a heterodimer composed of one alpha and one beta chain. Both alpha and beta chains share significant homology to immunoglobulin variable light chains. This gene encodes the CD8 beta chain isoforms. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct membrane associated or secreted isoforms have been described. A pseudogene, also located on chromosome 2, has been identified. [provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A study in humans using single-cell RNA sequencing of PBMCs from an irradiated patient and healthy controls demonstrated that the CD8B was highly expressed in specific T cell subsets (T2, T3, and T4) [Yan et al. DOI:10.3892/etm.2025.12846]. A study in human skin tissue demonstrated that the proportion of CD8+ T cells was significantly lower in burn tissue compared to non-burn tissue [Labuz et al. DOI:10.7554/eLife.82626].