Basic Information

Symbol
CDC14A
RNA class
mRNA
Alias
Cell Division Cycle 14A DFNB105 Cdc14 CDC10 (Cell Division Cycle 10, S. Cerevisiae, Homolog) Dual Specificity Protein Phosphatase CDC14A CDC14 Cell Division Cycle 14 Homolog A Cdc14A1 Cdc14A2 DFNB32 CDC14 Cell Division Cycle 14 Homolog A (S. Cerevisiae) Deafness, Autosomal Recessive 32 EC 3.1.3.16 EC 3.1.3.48 DFNB35 HCDC14
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_003672.4
Sequence length
4231.0 nt
GC content
0.4070

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1143.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1225.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1102.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((....((((((((......))))((((((.(((.(((((........)))))))).))))))...((((((((((((((((.........))))....))))).)))))))(((((((((((.(((.((.....)).))).)))).)))).))).)))).)))))))))))((((((((..(((.....))).)))((((.((..((((((....))))))..))...((((((((.(((((((((......((((((((((.((..((((.(((........)))))))..((((...))))((((((((((.....(((((((......(((((......)))))..)))))))...))))))))))...))))))))))))....((((...(((((.......)))))......((((((.(((((......)))))))).)))))))))))))))....).))))))))(((((((.(......(((((....(((((...........((((((((........(((........)))....((((........)))).))))))))............))))).....)))))))))))))(((((((.........))))))).............((..((.((((((((((((((((((((((.(.......(((.((....(((((......)))))...)).))).......).))))))...(((((...((((((..(((......)))........((.(((((..((((.......))))..(((((((((((((((((..(((((...(((((....))))))))))((((......)))).(((((((..((((.(((((.(((((..((((((((...............)))))))))))))))))).)))).)))).)))......((((((((((...(((((((((...........(((((....)))))....)))))))))(((((((((.(((((((...........(((......(((((((((((((.((((...((((....))))..............(((((.(.(((((((((((((..(((.................(((((..((((((....)).)))).))))).......(((.(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))).))))))....))))))))..)))))).)))..)))((..(((((((..(((......)))..)))))))..))...)))...))))))))..)).))).).))))).(((((((..........((((((((((.((.((((...))))........))...)))).))))))..(((((...)))))..(((..((((..............))))...)))..................)))))))(((((.....)))))..)))).((((((((((.............))))).)))))))))))))))))).....)))...)))))))..........(((......)))(((((......((((((.((......(((...))))).))))))...........(((((((((.....))))).))))...((....)).....(((((((..(((..((((..((((((.....((((.((((((.(((((((((((.(((((((.......((((..(((........)))...))))(((((.((....)).))))).))))))))))))..))))))....(((...((..........))..)))..(((((((..(((.(.....((......))...).)))))))))).....(((((((((.(((((...(((.((((....)))).))).(((.((((..........((((........))))................((((............))))....((((..(((((((((((...((((((..........)))))).((((((((.(((.((.(((((.(((((...........)))))...(((.........)))...........((((((((.(....(((((((((((((((((((((...((..(((((..((.....))...(((((.((((.(((((((((((.((((.(((((............((((((.(((......)))))))))))))))))).))).))))))))........(((.(((((((..............((((.((.((((((((.(((((((((.(((....((((.((((((((((...)))..........................((((((....))))))..........)))))))..))))......))).))))))))))))))))).((((((((.....))))))))...............(((((......)))))..(((((((.(((((((..((((((.....))))))....))))))))))))))..........(((((((.((((....((((..(((((((...(((.((((........))))..)))....))))))).))))...)))).)))))))))))))...((((.....))))((((((...))))))))).)))).)))..((((.(((...((((.........)))).))).)))).))))))))).)))))..))...))))))(((((........)))))............((((((((....)))).)))).)).)))))))))))))..(((((..........))))).......).)))))))).............)))))))...)))))))))))..............(((((((.........))))))).....(((((.((((((..(.(((((((((.......))))))))).)...((((((...))))))...............)))))).)))))..((((((((((.((((....))))..)))))).))))))))))))))))))).........))))..))).((((((((...((......))...)))))))).....(((((((...((((.(((((........)))))...........(((((.......)))))))))....)).)))))...(((((((((((((....(((((((((((......))).........))))))))....))).(((((((...)))))))...........)))))))))).......)))))...)))))).)))..........)))))).))))..))))))...))))..)))..)))))))((((((((..(((.(((....))).))))))))))).)))))..)))))))))..))))))))))......)))))).))))...)))))))..........))))).)).((((((.(((((((((((((.(........).))))))..))))))))))))).(((.(((((.........)))))..))).)))))))))))...........(((.....))).....)))))))))))))))).))..))..............)))).....(((((.(((((((...((((((.(((((((((((((.((((((....))))))..................(((((((((.(.((((((((((((((((((...............))))))..)))))))....((((((.(.((((((.((((.((((((..........((((......)))))))))).)))).)))))).)..(((.....))).....)))))).....((((((((((((((((((.((((((.((((((((.((................)).)))))))).))))))))))).(((.....))))))))))).)))))........(((((((((((.......((.((((((....)))))).))....)))))))))))))))).))))))))))..)))))))))))))...))))))....)))))))))))))))))....(((((........))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((((,.{{({{{((((......))))((((((.(({{(((((........)))))))).))))))...((((((((((((((((.........))))....))))),,))))))(((((((((((.((({,,....,)}.})).)))).)))).)))})),).)))))))))))((((((((..(((.....))).)))(({{.((..((((((....)))))),.))...((({(((({(((((((({.{{...((((((((((.{{,,((((.(((........)))))))..((((...)))}((((((((((.....(((((((......(((((......)))))..)))))))...))))))))))...))))))))))))|.,,,..,,,.(((((.......))))).,{,,.(({(((.(((((......)))))))),))),),,)))))))),..,)})))))))}(((((((.,......{((((....(((((,.......,,.{{{{{||{...,|...|||,,,.,...}}}.,,,((((......,,)))).}|||||}}.....,,.....}}))),,,,,)))))}))))))){((({((,{.......))))))),............{,..((,(((((((((((((((({,,{{,.{,..,,,,(((,,,....(((((,.....,}))),,.}}.||,...,,.,}.)))))}.,.(((((...((((((..{((......}}}.,,.....,{.({((({.{(((,,.....})))..||||{{{((((((((((..(((((...(((((....)))))))))){{{(......}}}}.((((((({.(((({(((((.(((((..((((((((,.,,.........,,)))))))})))))}}}}|.||||{||}|,||,......||||||{|||,.}|||||.|||}}}},.,,,..(((((....)))))....,,,||||||{((((((({.(((((((,......,...,{{......((((((((((((({,{,.,,{({((,,..,,,,,,{{{{,{{....,{(({..{{{{.,,||,{{{||||||{,............,,.{(((((..{{,|||},,.}).}}}},)))))}|||...,{{.(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))),))))))....))))))))..)))))).)))..}}|,{..{((((((..(((......)))..)))))))..}}.}}}}},,,},,,..}}(((((((..{,,,.(((.....)))..}},,...((((((((((,((.,{{{...,,,,........)}...)))).))))))..(((({...}))))})))))}.,{{,....{{.,{{{.{|||,{{(((({...,........)})))))}}|,,(((((,....))))}.}))),}|,,{,|||||.............})),,,)}}})))))))))))))).....}}}...)))))))..........{((,.....)}}(((((......((((((.((......(((...))))).))))))..,,..,.|{{{|{{|||||,,},,))))).}}},...||,...}}.....(((((((..{((..((((..{{{{{{.....((((.{{(({{{((((((((({{{(((((((.......,(((..(((........)}}..,)))|(((((.((....)).))))),))))))))))))..)))))}.||{(({..,({,,........||{.|||,.(((((((.{((,.,,,...,,......))}..,.)))))))))).....(((((((((.(((((...(((.((((....)))).))).,,,...,{,.....,|..((((........)))}.....{{{........|||,............}}}}....,{,{..((((((((((({{{((((((..........)))))).{(((((((.(((.(.((((((.(((((...........))))).,.(((.........)))|,,........{(((((((.(....(((((((((((((,(({{{(({{.(({.((({....|}}}..}},,,||(({{{(({,((((((((({(.((((((,,,...}}}.}}}.,,,,|||}.}}))}...,}})))),))))}},{(({,....)))))||{{(({{...{((((((((((.(((({........{{{{,{,.((((((((.(((((((((.(((....((((.{((((((,{,...,....,.......,,,..,.,,,..,}|,((((((....)))))).......,,.)))))))..))))......))).))))))))))))))))).,((((({{.,,{{||||,,,,,}}}}}}}.,..||,|{(((......)))}}..{{(((((,(((((((..((((((.....)))))}....)))))))})))))},,,{{|||,.(((((((.(({(...,{,((,.(((((((...{((.{{{{,......,)))),.)})....))))))),,))),,.)))),)))))))}}}}}}...{{{{.....}}}}((((((...,,,)))}))}))))))))}.{{{{.(((...((((.,.....,.)))).))}.})}}..))))))...)))).}})),{((({{(.(((((........))))).)},..)))},.((((((((....)))).)))).)).)))))))))))))..,((((,{{,......,,,,),,},,,.).)))))))}.......},}...))))))}...))))))))))}............,.(((((((.........})))))).....|{{{{.{{{(((..{,(((((((((.......))))))))).},,,{{{{{,...}})))}...............}}}}}}.}))))..((((((((((.((((....))))..)))))).)))))))))))))))})))..,{.....}))),.,,..((((((((...((......))...))))))))....|{,{|({{,,.|||||{((((........))))}..,,,,,,...|||||,......},,||{{((....)).))))....{(((((((((,,,....(((((((((((......))).........))))))))...,|||,{{{{{{|,,,)))||}}.......,,}.)))))))))}.......)))))...)))))).))).......,..,})))).)))).,)))}})...))))..))),,))))))){{{{{(({..{{{.(((....}}}.}}}}))))}}}.}}}}}..}}}}})))),.}}}}}}}}},.,,}},)))))).))))...})))))}..........}}}}}.||,((((((.{{((((({{{{{{,{{,,,,,....))))))}.})))))))))))}}|||.|||{{.,,,.....})))),,}}}.)))))))))))...........{{,...},}},.....})))))))))))))))})...,}.....,.......,))}}.....(((((.(((((((...((((((.(((((((((((((.{(((((....}}}}},....,....,,,,.....(((((((((.{.((((((((((((((((((...............))))))..))))))),..,((((({.(.{,(((,.((,({(((((({{{...,,..((((......)))),,})),,)))).}}})))})..|,,}}}...)).,...))))))....,((((((((((((((((((.((((((.((((((((.{{.,..........,...}).)))))))).))))))))))).(((.....)))))))))))}})))),...,,.{(((((((((((.......{{.{(((({....)))))).)).,.,))))))))))))}))).))))))))))..)))))))))))))...))))))....)))))))))))))))))..,,{{,{{,......,))))}.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCAGCUGCUGCCAGCCCGCGGGCACUGAAGUCCUCCCGGCUGCCGCUC… 4355 nt 0.4078
AAGGACCGAAAGAACGUGAGUGAGAGCAGGGGAAUUUAGGAAUCCAUUG… 2087 nt 0.4471
AGCAGCUGCUGCCAGCCCGCGGGCACUGAAGUCCUCCCGGCUGCCGCUC… 2314 nt 0.5017
AGCAGCUGCUGCCAGCCCGCGGGCACUGAAGUCCUCCCGGCUGCCGCUC… 4231 nt 0.4070
AGCAGCUGCUGCCAGCCCGCGGGCACUGAAGUCCUCCCGGCUGCCGCUC… 2402 nt 0.4967
AGCAGCUGCUGCCAGCCCGCGGGCACUGAAGUCCUCCCGGCUGCCGCUC… 2505 nt 0.4387
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the dual specificity protein tyrosine phosphatase family. It is highly similar to Saccharomyces cerevisiae Cdc14, a protein tyrosine phosphatase involved in the exit of cell mitosis and initiation of DNA replication, suggesting a role in cell cycle control. This protein has been shown to interact with, and dephosphorylate tumor suppressor protein p53, and is thought to regulate the function of p53. Alternative splicing of this gene results in several transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.