Basic Information
Symbol
CDC25B
RNA class
mRNA
Alias
Cell Division Cycle 25B
M-Phase Inducer Phosphatase 2
Dual Specificity Phosphatase Cdc25B
EC 3.1.3.48
MPIP2
CDC25 Homolog B (S. Pombe)
CDC25 Homolog B
CDC25HU2
Location (GRCh38)
20:3786772-3806730
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
MANE select
Transcript ID
NM_021873.4
Sequence length
3119.0 nt
GC content
0.5906
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1184.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1238.95 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
891.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GGGGACGCGGUGCAUCGCUACUGCGCCCGGCGGACAGCGACUUGCUGCU… | 2886 nt | 0.5544 | |
| GGGGACGCGGUGCAUCGCUACUGCGCCCGGCGGACAGCGACUUGCUGCU… | 2844 nt | 0.5538 | |
| GGGGACGCGGUGCAUCGCUACUGCGCCCGGCGGACAGCGACUUGCUGCU… | 2805 nt | 0.5558 | |
| AGAGGCGCCUGGAGCGAGCGAAUCCUGGCCCACCGCCUGCCCAACCGCG… | 2746 nt | 0.5652 | |
| AGAGGCGCCUGGAGCGAGCGAAUCCUGGCCCACCGCCUGCCCAACCGCG… | 2788 nt | 0.5656 | |
| AGAGGCGCCUGGAGCGAGCGAAUCCUGGCCCACCGCCUGCCCAACCGCG… | 2665 nt | 0.5610 | |
| AUUCUCUGGGCUUUCUUUCAUUCAGGGCAGCCUUUAAAAUUCCAAGCUG… | 2634 nt | 0.5588 | |
| AGAGGCUUCCCUGGCUGGUGCCUGAGCCCGGCGUCCCUCGCCCCCCGCC… | 3077 nt | 0.5905 | |
| AGAGGCUUCCCUGGCUGGUGCCUGAGCCCGGCGUCCCUCGCCCCCCGCC… | 2996 nt | 0.5874 | |
| AGAGGCUUCCCUGGCUGGUGCCUGAGCCCGGCGUCCCUCGCCCCCCGCC… | 3119 nt | 0.5906 |
Summary
CDC25B is a member of the CDC25 family of phosphatases. CDC25B activates the cyclin dependent kinase CDC2 by removing two phosphate groups and it is required for entry into mitosis. CDC25B shuttles between the nucleus and the cytoplasm due to nuclear localization and nuclear export signals. The protein is nuclear in the M and G1 phases of the cell cycle and moves to the cytoplasm during S and G2. CDC25B has oncogenic properties, although its role in tumor formation has not been determined. Multiple transcript variants for this gene exist. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the CDC25B mRNA in cardiac tissue is a sensitive marker for estimating the early postmortem interval (EPMI) up to 24 hours, where its △Cq value showed the highest correlation with EPMI at both 25°C and 35°C and was used to build a cubic mathematical model [Tao et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2018.09.004]; validation testing of this model using independent samples resulted in relative error rates of less than 15%, indicating its efficacy for forensic PMI estimation [Tao et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2018.09.004]. A subsequent review confirmed that the CDC25B had the best correlation with time within 24 hours after death in a rat study, highlighting its application for PMI estimation [Nanny Wenzlow et al. DOI:10.1177/10406387231153930].