Basic Information

Symbol
CDC25C
RNA class
mRNA
Alias
Cell Division Cycle 25C M-Phase Inducer Phosphatase 3 PPP1R60 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 60 EC 3.1.3.48 CDC25 Dual Specificity Phosphatase CDC25C Dual Specificity Phosphatase Cdc25C Phosphotyrosine Phosphatase CDC25 Homolog C (S. Pombe) Mitosis Inducer CDC25 CDC25 Homolog C
Location (GRCh38)
5:138285251-138338355
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001790.5
Sequence length
2093.0 nt
GC content
0.4634

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-646.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -683.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 657.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001287582.2 NCBI
AUUCUUGCUCAGAGGCCGUAACUUUGGCCUUCUGCUCAGGGAAGACUCU… 2089 nt 0.4634
NM_001287583.2 NCBI
GAGGCCCCAGCGCCACCUGCCCUCCACCACCUACCGCGGUUCCUCCAGC… 2265 nt 0.4887
NM_001318098.2 NCBI
GAGGCCCCAGCGCCACCUGCCCUCCACCACCUACCGCGGUUCCUCCAGC… 2269 nt 0.4888
NM_001364026.1 NCBI
GAGGUGCCCGCCCCGAGGCCCCAGCGCCACCUGCCCUCCACCACCUACC… 2220 nt 0.4914
NM_001364027.1 NCBI
AGCUUAGAGGCGAGCGGGGAUAGGUUACUGGGCUGGCGGAAGGUUUGAA… 2064 nt 0.4695
NM_001364028.1 NCBI
AGCUUAGAGGCGAGCGGGGAUAGGUUACUGGGCUGGCGGAAGGUUUGAA… 2037 nt 0.4674
NM_001790.5 NCBI
AUUCUUGCUCAGAGGCCGUAACUUUGGCCUUCUGCUCAGGGAAGACUCU… 2093 nt 0.4634
NM_022809.4 NCBI
AUUCUUGCUCAGAGGCCGUAACUUUGGCCUUCUGCUCAGGGAAGACUCU… 1874 nt 0.4648
Summary

This gene encodes a conserved protein that plays a key role in the regulation of cell division. The encoded protein directs dephosphorylation of cyclin B-bound CDC2 and triggers entry into mitosis. It also suppresses p53-induced growth arrest. Multiple alternatively spliced transcript variants of this gene have been described. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.