Forensic RNA Knowledge Base

Basic Information

Symbol

CDC34

RNA class

mRNA

Alias

Cell Division Cycle 34, Ubiquitin Conjugating Enzyme UBE2R1 E2-CDC34 UBC3 (E3-Independent) E2 Ubiquitin-Conjugating Enzyme R1 Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2-CDC34 Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2 R1 E2 Ubiquitin-Conjugating Enzyme R1 Ubiquitin-Protein Ligase R1 UBCH3 Cell Division Cycle 34, Ubiqiutin Conjugating Enzyme Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2-32 KDA Complementing Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2-32 KDa Complementing Ubiquitin Conjugating Enzyme E2 R1 Cell Division Cycle 34 Homolog Ubiquitin Carrier Protein Cell Division Cycle 34 EC 2.3.2.23 EC 2.3.2.24 EC 6.3.2.19

Location (GRCh38)

19:531721-542092

UCSC Genome Browser Search in Marker Scope

Forensic tag(s)

Drug abuse diagnoses

External database

HGNC

NCBI

Ensembl

OMIM

UniProt

GTEx

MANE select

Transcript ID

NM_004359.2

Sequence length

1418.0 nt

GC content

0.6509

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.

Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.

Minimum free energy

-642.50 kcal/mol

Thermodynamic ensemble

Free energy: -669.28 kcal/mol

Frequency: 0.0000

Diversity: 243.82

MFE Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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Transcripts

ID	Sequence	Length	GC content
NM_004359.2 NCBI	AGAGCUGCUGGAGCGCUCGGGGUCCCCGGGCGGCGGCGGCGGCGCAGAG…	1418 nt	0.6509

Summary

The protein encoded by this gene is a member of the ubiquitin-conjugating enzyme family. Ubiquitin-conjugating enzyme catalyzes the covalent attachment of ubiquitin to other proteins. This protein is a part of the large multiprotein complex, which is required for ubiquitin-mediated degradation of cell cycle G1 regulators, and for the initiation of DNA replication. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the CDC34 in microglial cells, as part of a broad disruption of the ubiquitin-mediated proteolysis pathway revealed by single-cell RNA sequencing [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].