Basic Information

Symbol
CDC42
RNA class
mRNA
Alias
Cell Division Cycle 42 CDC42Hs G25K Cell Division Control Protein 42 Homolog GTP Binding Protein, 25kDa G25K GTP-Binding Protein DJ224A6.1.1 (Cell Division Cycle 42 (GTP-Binding Protein, 25kD)) DJ224A6.1.2 (Cell Division Cycle 42 (GTP-Binding Protein, 25kD)) Cell Division Cycle 42 (GTP Binding Protein, 25kDa) Cell Division Cycle 42 (GTP-Binding Protein, 25kD) Small GTP Binding Protein CDC42 Growth-Regulating Protein EC 3.6.5.2 TKS
Location (GRCh38)
1:22052627-22101360
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from respiratory system disease
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001791.4
Sequence length
10503.0 nt
GC content
0.4208

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3177.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3380.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2853.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039802.2 NCBI
GCAGUGCUGCCAACGCCCCGGUGGAGAAGCUGAGACGGAGUCUCACUGU… 10629 nt 0.4232
NM_001791.4 NCBI
GCAGUGCUGCCAACGCCCCGGUGGAGAAGCUGAGGUCAUCAUCAGAUUU… 10503 nt 0.4208
NM_044472.3 NCBI
GCAGUGCUGCCAACGCCCCGGUGGAGAAGCUGAGGUCAUCAUCAGAUUU… 1435 nt 0.3951
Summary

The protein encoded by this gene is a small GTPase of the Rho-subfamily, which regulates signaling pathways that control diverse cellular functions including cell morphology, migration, endocytosis and cell cycle progression. This protein is highly similar to Saccharomyces cerevisiae Cdc 42, and is able to complement the yeast cdc42-1 mutant. The product of oncogene Dbl was reported to specifically catalyze the dissociation of GDP from this protein. This protein could regulate actin polymerization through its direct binding to Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP), which subsequently activates Arp2/3 complex. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. Pseudogenes of this gene have been identified on chromosomes 3, 4, 5, 7, 8 and 20. [provided by RefSeq, Apr 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CDC42 is downregulated in lung tissues and endothelial cells following seawater drowning, contributing to acute lung injury via endothelial hyperpermeability and inflammation [Chen et al. DOI:10.1016/j.lfs.2025.124109].