Basic Information

Symbol
CDC5L
RNA class
mRNA
Alias
Cell Division Cycle 5 Like PCDC5RP CEF1 CDC5 Cell Division Cycle 5-Like Protein Pombe Cdc5-Related Protein HCDC5 CDC5 (Cell Division Cycle 5, S. Pombe, Homolog)-Like CDC5 Cell Division Cycle 5-Like (S. Pombe) CDC5 Cell Division Cycle 5-Like DJ319D22.1 (CDC5-Like Protein) Cell Division Cycle 5-Like Cdc5-Related Protein Cdc5-Like Protein DJ319D22.1 CDC5-LIKE KIAA0432
Location (GRCh38)
6:44387565-44450425
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001253.4
Sequence length
6241.0 nt
GC content
0.3841

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1698.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1823.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1509.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001253.4 NCBI
CUUCAAAGCAGAAGGUCGCGCUUGGAGGAAGUGGCGGCUUUGAGUCCGG… 6241 nt 0.3841
Summary

The protein encoded by this gene shares a significant similarity with Schizosaccharomyces pombe cdc5 gene product, which is a cell cycle regulator important for G2/M transition. This protein has been demonstrated to act as a positive regulator of cell cycle G2/M progression. It was also found to be an essential component of a non-snRNA spliceosome, which contains at least five additional protein factors and is required for the second catalytic step of pre-mRNA splicing. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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