Basic Information

Symbol
CDH2
RNA class
mRNA
Alias
Cadherin 2 CDHN CD325 NCAD Cadherin 2, Type 1, N-Cadherin (Neuronal) Neural Cadherin N-Cadherin Cadherin-2 CDw325 Calcium-Dependent Adhesion Protein, Neuronal CD325 Antigen N-Cadherin 1 ARVD14 ACOGS ADHD8
Location (GRCh38)
18:27932879-28177946
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001792.5
Sequence length
4016.0 nt
GC content
0.4310

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1124.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1199.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1100.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308176.2 NCBI
CAAAAGAACUUUAUCCCUGCUUUCAUUCUGACAUACCUAUUAUGACUUU… 3908 nt 0.4122
NM_001792.5 NCBI
GCCGUUUCUCCGCGCCGCUGUUGGUGCUGCCGCUGCCUCCUCCUCCUCC… 4016 nt 0.4310
Summary

This gene encodes a classical cadherin and member of the cadherin superfamily. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein is proteolytically processed to generate a calcium-dependent cell adhesion molecule and glycoprotein. This protein plays a role in the establishment of left-right asymmetry, development of the nervous system and the formation of cartilage and bone. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

A study in human arrhythmogenic cardiomyopathy (AC) hearts demonstrated reduced localization of the CDH2 to intercalated discs, though consistent changes in total protein levels were not detected [Chen et al. DOI:10.1161/CIRCRESAHA.114.302810]. In a separate human study of sudden unexplained death (SUD), the CDH2 was listed among differentially expressed cardiac-related genes, with mutations reported in ion channelopathies or cardiomyopathies [Neubauer et al. DOI:10.1007/S00414-025-03414-4].