Basic Information

Symbol
CDK11A
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin Dependent Kinase 11A CDK11-P110 CDK11-P58 CDK11-P46 PITSLRE P58GTA CDC2L2 CDC2L3 Galactosyltransferase-Associated Protein Kinase P58/GTA Cell Division Cycle 2-Like 2 (PITSLRE Proteins) PITSLRE Serine/Threonine-Protein Kinase CDC2L2 Cell Division Cycle 2-Like Protein Kinase 2 Cell Division Protein Kinase 11A Cyclin-Dependent Kinase 11A EC 2.7.11.22 Cell Division Cycle 2-Like 2 PITSLRE B EC 2.7.11 PITSLREB
Location (GRCh38)
1:1702379-1724482
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024011.4
Sequence length
2984.0 nt
GC content
0.5600

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1066.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1116.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 778.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001313896.2 NCBI
AUAUCAUCAUUAGGCGUCAACACAGGAAGUGAGGAUACUUCUGGCGAGC… 2993 nt 0.5623
NM_001313982.2 NCBI
AUAUCAUCAUUAGGCGUCAACACAGGAAGUGAGGAUACUUCUGGCGAGC… 2981 nt 0.5606
NM_024011.4 NCBI
AUAUCAUCAUUAGGCGUCAACACAGGAAGUGAGGAUACUUCUGGCGAGC… 2984 nt 0.5600
NM_033529.4 NCBI
AUAUCAUCAUUAGGCGUCAACACAGGAAGUGAGGAUACUUCUGGCGAGC… 2954 nt 0.5603
Summary

This gene encodes a member of the serine/threonine protein kinase family. Members of this kinase family are known to be essential for eukaryotic cell cycle control. Due to a segmental duplication, this gene shares very high sequence identity with a neighboring gene. These two genes are frequently deleted or altered in neuroblastoma. The protein kinase encoded by this gene can be cleaved by caspases and may play a role in cell apoptosis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.