Basic Information

Symbol
CDK13
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin Dependent Kinase 13 CDC2L CHED Cholinesterase-Related Cell Division Controller KIAA1791 CDC2L5 Cell Division Cycle 2-Like Protein Kinase 5 Cell Division Protein Kinase 13 CDC2-Related Protein Kinase 5 Cyclin-Dependent Kinase 13 EC 2.7.11.22 HCDK13 Cell Division Cycle 2-Like 5 (Cholinesterase-Related Cell Division Controller) EC 2.7.11.23 EC 2.7.11 CHDFIDD
Location (GRCh38)
7:39950121-40099580
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003718.5
Sequence length
9525.0 nt
GC content
0.4348

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2924.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3101.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2380.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003718.5 NCBI
ACUUCCGCGUUGCGCUGCCCGAGCCGAGAGCGCGGCCAAGGCCGCUCCC… 9525 nt 0.4348
NM_031267.3 NCBI
GCAUCUGGUGUUUUCGCUGCCGAGGAUAGGACGACGAGCGCAAUCGGGA… 6805 nt 0.4733
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the cyclin-dependent serine/threonine protein kinase family. Members of this family are well known for their essential roles as master switches in cell cycle control. The exact function of this protein has not yet been determined, but it may play a role in mRNA processing and may be involved in regulation of hematopoiesis. Alternatively spliced transcript variants have been described.[provided by RefSeq, Dec 2009]

Forensic Context

A study in human menstrual blood-derived stem cells (MenSCs) identified the CDK13 as a differentially-expressed gene that is down-regulated with increasing passage number in vitro, where it functions to positively regulate cell proliferation by promoting cell division [Chen et al. DOI:PMC4713568].