Basic Information
Symbol
CDKN1B
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 1B
KIP1
P27KIP1
Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor 1B (P27, Kip1)
Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor 1B
Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor P27
P27Kip1
CDKN4
MEN1B
MEN4
P27
Location (GRCh38)
12:12685498-12722373
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_004064.5
Sequence length
2411.0 nt
GC content
0.4591
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-772.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-821.57 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
645.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| CUUCUUCGUCAGCCUCCCUUCCACCGCCAUAUUGGGCCACUAAAAAAAG… | 2411 nt | 0.4591 |
Summary
This gene encodes a cyclin-dependent kinase inhibitor, which shares a limited similarity with CDK inhibitor CDKN1A/p21. The encoded protein binds to and prevents the activation of cyclin E-CDK2 or cyclin D-CDK4 complexes, and thus controls the cell cycle progression at G1. The degradation of this protein, which is triggered by its CDK dependent phosphorylation and subsequent ubiquitination by SCF complexes, is required for the cellular transition from quiescence to the proliferative state. Mutations in this gene are associated with multiple endocrine neoplasia type IV (MEN4). [provided by RefSeq, Apr 2014] CIViC Summary for CDKN1B Gene
Forensic Context
A review of temperature-dependent RNA metabolism noted that in mice and other species, the translation of the CDKN1B mRNA is enhanced at lower temperatures through binding by the cold-inducible RNA-binding protein CIRBP, which affects its stability and translation to reduce cell division [Becskei & Rahaman DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.008].